我很难把这些部件正确地连接起来。我有Spark安装和工作成功,我可以运行作业本地,独立,也可以通过Yarn。我(据我所知)在这里和这里遵循了建议的步骤
我正在开发ubuntu,我拥有的各种组件版本
spark-1.5.1-bin-hadoop2.6
hadoop hadoop-2.6.1版本
蒙哥2.6.10
mongo hadoop连接器克隆自https://github.com/mongodb/mongo-hadoop.git
python 2.7.10版
我在执行各种步骤时遇到了一些困难,例如要将哪些jar添加到哪个路径,所以我添加的是
在 /usr/local/share/hadoop-2.6.1/share/hadoop/mapreduce
我补充说 mongo-hadoop-core-1.5.0-SNAPSHOT.jar
以下环境变量 export HADOOP_HOME="/usr/local/share/hadoop-2.6.1"
export PATH=$PATH:$HADOOP_HOME/bin export SPARK_HOME="/usr/local/share/spark-1.5.1-bin-hadoop2.6"
export PYTHONPATH="/usr/local/share/mongo-hadoop/spark/src/main/python" export PATH=$PATH:$SPARK_HOME/bin
我的python程序是basic
from pyspark import SparkContext, SparkConf
import pymongo_spark
pymongo_spark.activate()
def main():
conf = SparkConf().setAppName("pyspark test")
sc = SparkContext(conf=conf)
rdd = sc.mongoRDD(
'mongodb://username:password@localhost:27017/mydb.mycollection')
if __name__ == '__main__':
main()
我正在用命令运行它
$SPARK_HOME/bin/spark-submit --driver-class-path /usr/local/share/mongo-hadoop/spark/build/libs/ --master local[4] ~/sparkPythonExample/SparkPythonExample.py
我得到了以下结果
Traceback (most recent call last):
File "/home/me/sparkPythonExample/SparkPythonExample.py", line 24, in <module>
main()
File "/home/me/sparkPythonExample/SparkPythonExample.py", line 17, in main
rdd = sc.mongoRDD('mongodb://username:password@localhost:27017/mydb.mycollection')
File "/usr/local/share/mongo-hadoop/spark/src/main/python/pymongo_spark.py", line 161, in mongoRDD
return self.mongoPairRDD(connection_string, config).values()
File "/usr/local/share/mongo-hadoop/spark/src/main/python/pymongo_spark.py", line 143, in mongoPairRDD
_ensure_pickles(self)
File "/usr/local/share/mongo-hadoop/spark/src/main/python/pymongo_spark.py", line 80, in _ensure_pickles
orig_tb)
py4j.protocol.Py4JError
根据这里
当java客户机代码中发生异常时,会引发此异常。例如,如果您尝试从空堆栈中弹出一个元素。抛出的java异常示例存储在java\u异常成员中。
查看源代码 pymongo_spark.py
它说,这条线抛出了错误
“与jvm通信时出错。mongodb spark jar在spark的类路径上吗?“
因此,作为回应,我试图确保正确的jar被传递,但我可能会做错这一切,见下文
$SPARK_HOME/bin/spark-submit --jars /usr/local/share/spark-1.5.1-bin-hadoop2.6/lib/mongo-hadoop-spark-1.5.0-SNAPSHOT.jar,/usr/local/share/spark-1.5.1-bin-hadoop2.6/lib/mongo-java-driver-3.0.4.jar --driver-class-path /usr/local/share/spark-1.5.1-bin-hadoop2.6/lib/mongo-java-driver-3.0.4.jar,/usr/local/share/spark-1.5.1-bin-hadoop2.6/lib/mongo-hadoop-spark-1.5.0-SNAPSHOT.jar --master local[4] ~/sparkPythonExample/SparkPythonExample.py
我已经进口了 pymongo
到同一个python程序来验证我至少可以使用它访问mongodb,而且我可以。
我知道这里有很多活动部件,所以如果我能提供更多有用的信息请告诉我。
4条答案
按热度按时间mqkwyuun1#
你能试着用吗
--package
选项而不是--jars ...
在spark submit命令中:其中一些jar文件不是uberjar,需要下载更多依赖项才能开始工作。
wd2eg0qa2#
更新:
2016-07-04
自从上次更新mongodb spark connector以来,它已经成熟了很多。它提供了最新的二进制文件和基于数据源的api,但它使用的是
SparkConf
因此它在主观上不如stratio/spark mongodb灵活。2016-03-30
从最初的答案开始,我找到了两种不同的方法从spark连接到mongodb:
mongodb/mongo spark公司
stratio/spark mongodb公司
虽然前者看起来相对不成熟,但后者看起来比mongo-hadoop连接器更好,并提供了sparksqlapi。
似乎比以前稳定多了
mongo-hadoop-spark
,支持 predicate 下推,无需静态配置,工作简单。最初的答案是:
事实上,这里有相当多的运动部件。我试图通过构建一个简单的docker映像使其更易于管理,该映像与所描述的配置大致匹配(不过为了简洁起见,我省略了hadoop库)。你可以在上找到完整的源代码
GitHub
(doi 10.5281/zenodo.47882)从头开始:或者下载一张我推送到docker hub的图片,这样你就可以
docker pull zero323/mongo-spark
):开始图像:
开始Spark壳传递
--jars
以及--driver-class-path
:最后看看它是如何工作的:
请注意,mongohadoop似乎在第一次操作之后关闭了连接。比如说打电话
rdd.count()
collect之后将引发异常。基于我在创作这张照片时遇到的不同问题,我倾向于相信
mongo-hadoop-1.5.0-SNAPSHOT.jar
以及mongo-hadoop-spark-1.5.0-SNAPSHOT.jar
对双方--jars
以及--driver-class-path
是唯一的硬性要求。笔记:
这张图片大致基于jaceklaskowski/docker spark,所以请务必发送一些好的因果报应给@jaceklaskowski,如果它有帮助的话。
如果不需要包含新api的开发版本,则使用
--packages
很可能是更好的选择。nszi6y053#
我昨天也有同样的问题。通过放置
mongo-java-driver.jar
在$HADOOP_HOME/lib
以及mongo-hadoop-core.jar
以及mongo-hadoop-spark.jar
在$HADOOP_HOME/spark/classpath/emr
(或$SPARK_CLASSPATH
).如果有帮助请告诉我。
zlhcx6iw4#
祝你好运!
@看到了吗https://github.com/mongodb/mongo-hadoop/wiki/spark-usage