Where do I save these files and where do I compile them? Should I compile this on my win 7 machine running visual studio 12 and then move it to the ubuntu vm?

你可以把map reduce类保存在任何地方（win7或者ubuntuvm）。你也可以在任何地方编译它。只需用创建的类创建一个jar文件，然后在vm中运行map reduce。
然后在启动hadoop后的ubuntuvm中，可以使用以下命令运行创建的map reduce类。

<Path To Hadoop Bin>/hadoop jar <Path to Jar>/<Jar Name>.jar <Map Reduce Class Name> <Class Arguments> ...

运行上述命令时，您编写的map reduce类将与hbase表一起执行。
希望这有帮助

无需编写mapreduce作业来将数据批量加载到hbase中。有几种方法可以将数据批量加载到hbase中：
1） 使用hbase工具，如 importtsv 以及 completebulkload http://hbase.apache.org/book/arch.bulk.load.html
2） 使用清管器批量加载数据。例子：

A = LOAD '/hbasetest.txt' USING PigStorage(',') as 
      (strdata:chararray, intdata:long);
STORE A INTO 'hbase://mydata'
        USING org.apache.pig.backend.hadoop.hbase.HBaseStorage(
              'mycf:intdata');

3） 使用hbase api编程实现。我得到了一个名为hbaseloader的小项目，它将文件加载到hbase表（该表只有一个包含文件内容的列族）。看一下，您只需要定义表的结构并修改代码以读取csv文件并对其进行解析。
4） 使用mapreduce作业以编程的方式完成它，如您提到的示例中所示。