必须注入适当的实体管理器（即标识）。相应的服务名称是“条令.orm.identit\u实体\u管理器”。
如果您想在控制器中使用它，我建议将此服务绑定为services.yaml中的参数：

App\Controller\FooController:
        bind:
            $identityManager: '@doctrine.orm.identity_entity_manager'

然后在您的控制器中，只需通过自动布线将其注入并按预期使用即可：

class FooController extends AbstractController {

/**
 * @Route("/bar", name="bar")
 */
public function bar($identityManager) {
    ...
    $identityManager->getRepository(User::class)->findAll();
    ...
}

我已经从github下载并运行了你的项目。事实证明，正如我在评论中已经注意到的那样，问题是document.yaml中实体管理器的配置不好。为了让你的程序正常工作（对我来说是这样的），你需要创建两个新目录（/src/entity/first，/src/entity/second），将文件first.php和second.php分别放在这些目录中，然后将doctor.yaml中的配置改为

doctrine:
dbal:
    default_connection: default
    connections:
        default:
            url: '%env(DATABASE_URL)%'
            driver: 'pdo_mysql'
            server_version: '5.7'
            charset: utf8mb4
        second:
            url: '%env(SECOND_DATABASE_URL)%'
            driver: 'pdo_mysql'
            server_version: '5.7'
            charset: utf8mb4

orm:
    default_entity_manager: default
    entity_managers:
        default:
            connection: default
            mappings:
                Main:
                    is_bundle: false
                    type: annotation
                    dir: '%kernel.project_dir%/src/Entity/First'
                    prefix: 'App\Entity\First'
                    alias: First
        second:
            connection: second
            mappings:
                Second:
                    is_bundle: false
                    type: annotation
                    dir: '%kernel.project_dir%/src/Entity/Second'
                    prefix: 'App\Entity\Second'
                    alias: Second

你可以走了。
问题是您将两个实体管理器配置为处理相同的实体（通过orm部分中的“dir”和“prefix”选项）。这导致了与不可预测行为的冲突。实际上，由于这种冲突，在第二个类的存储库中调用的是第一个实体管理器。