我真的很想在我们的aws弹性mapreduce集群上利用pig中的python udfs,但是我不能让事情正常工作。无论我尝试什么,我的pig作业都会失败,并记录以下异常:
ERROR 2998: Unhandled internal error. org/python/core/PyException
java.lang.NoClassDefFoundError: org/python/core/PyException
at org.apache.pig.scripting.jython.JythonScriptEngine.registerFunctions(JythonScriptEngine.java:127)
at org.apache.pig.PigServer.registerCode(PigServer.java:568)
at org.apache.pig.tools.grunt.GruntParser.processRegister(GruntParser.java:421)
at org.apache.pig.tools.pigscript.parser.PigScriptParser.parse(PigScriptParser.java:419)
at org.apache.pig.tools.grunt.GruntParser.parseStopOnError(GruntParser.java:188)
at org.apache.pig.tools.grunt.GruntParser.parseStopOnError(GruntParser.java:164)
at org.apache.pig.tools.grunt.Grunt.exec(Grunt.java:81)
at org.apache.pig.Main.run(Main.java:437)
at org.apache.pig.Main.main(Main.java:111)
at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:39)
at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:25)
at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:597)
at org.apache.hadoop.util.RunJar.main(RunJar.java:156) Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: org.python.core.PyException
at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:202)
at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:190)
at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:306)
at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:247)
... 14 more
在elastic mapreduce中使用python UDF for pig需要做什么?
4条答案
按热度按时间qlvxas9a1#
到今天为止,在emr上使用pig 0.9.1,我发现以下内容已经足够了:
哪里
script.pig
做一个python脚本的寄存器,但不是jython.jar
:zyfwsgd62#
经过几次错误的转变,我发现,至少在hadoop的弹性map reduce实现上,pig似乎忽略了classpath环境变量。相反,我发现我可以使用hadoop\u classpath变量来控制类路径。
一旦我实现了这一点,就可以很容易地设置使用python UDF的内容:
安装jython
sudo apt-get install jython -y -qq
设置hadoop\u classpath环境变量。export HADOOP_CLASSPATH=/usr/share/java/jython.jar:/usr/share/maven-repo/org/antlr/antlr-runtime/3.2/antlr-runtime-3.2.jar
jar确保hadoop可以找到pyexception类antlr-runtime-3.2.jar确保hadoop可以找到charstream类
为jython创建缓存目录(这在jythonfaq中有文档记录)
sudo mkdir /usr/share/java/cachedir/
sudo chmod a+rw /usr/share/java/cachedir
我应该指出,这似乎与我在寻找解决这个问题的方法时发现的其他建议直接矛盾:设置classpath和classpath环境变量似乎没有任何作用。
包含udf的.py文件不需要包含在hadoop\u classpath环境变量中。
pig中使用的.py文件的路径
register
陈述可以是相对的,也可以是绝对的,似乎并不重要。i7uaboj43#
嗯…为了澄清我刚才读到的一些内容,在这里使用python-udf-in-pig在存储在s3上的emr上运行,它就像pig脚本中的这行代码一样简单:
使用jython作为mynamespace注册“s3://path/to/bucket/udfs.py”
也就是说,不需要修改类路径。我现在正在生产中使用它,不过需要注意的是,我没有在我的udf中引入任何额外的python模块。我认为这可能会影响到你需要做些什么来让它发挥作用。
ztmd8pv54#
我最近也遇到了同样的问题。你的答案可以简化。您根本不需要安装jython或创建缓存目录。您确实需要在emr引导脚本中包含jythonjar(或者做类似的事情)。我用下面几行代码编写了一个emr引导脚本。通过完全不使用s3cmd,而是使用作业流(将文件放在特定目录中),可以进一步简化这一点。通过s3cmd获取udf肯定是不方便的,但是,当使用pig的emr版本时,我无法在s3上注册udf文件。
如果您使用的是charstream,那么必须将该jar也包含到piglib路径中。根据您使用的框架,您可以将这些引导脚本作为选项传递给您的作业,emr通过其elasticmapreduceruby客户端支持这一点。一个简单的选择是将引导脚本放在s3上。
如果在引导脚本中使用s3cmd,则需要另一个执行类似操作的引导脚本。此脚本应按引导顺序放在另一个脚本之前。我正在远离使用s3cmd,但是为了我的成功尝试,s3cmd成功了。而且,s3cmd可执行文件已经安装在亚马逊的pig映像中(例如ami版本2.0和hadoop版本0.20.205)。
脚本#1(命令行)
脚本#2(播种jythonjar)