找到后，需要跳过找到的文本。
因为循环 i++ ，这意味着：

if (found) {
    res++;
    i += text1.length() - 1;
}

更新
另外，如果子字符串位于字符串的末尾，代码将找不到它，因为外循环结束得早，所以请更改 < 至 <= :

for (int i = 0; i <= text2.length() - text1.length(); i++) {

你就快到了。通过以下更改，您的代码将按预期工作：
增量 i 由 text1.length() - 1 每次 text1 找到并 j == text1.length() . 在你增加之后 i 由 text1.length() - 1 ，循环的增量部分将递增 i 由 1 这将导致 i 递增的 text1.length() .
从修改条件 i < text2.length() - text1.length() 至 i < text2.length() .
从修改条件 j<text1.length() && found 至 j < text1.length() && found && i + j < text2.length() .
你还可以通过在条件出现时立即中断内部循环来提高程序的效率， text1.charAt(j) != text2.charAt(i + j) 变成 true .

import java.util.Scanner;

class Main {
    public static void main(String[] args) {
        Scanner input = new Scanner(System.in);
        System.out.print("Enter the substring: ");
        String text1 = input.nextLine();
        System.out.print("Enter the string to search into: ");
        String text2 = input.nextLine();
        int res = 0;
        for (int i = 0; i < text2.length(); i++) {
            if (text1.charAt(0) == text2.charAt(i)) {
                boolean found = true;
                int j;
                for (j = 0; j < text1.length() && found && i + j < text2.length(); j++) {
                    if (text1.charAt(j) != text2.charAt(i + j)) {
                        found = false;
                        break;
                    }
                }
                if (j == text1.length() && found) {
                    res++;
                    i += text1.length() - 1;
                }
            }
        }
        System.out.println(res);
    }
}

示例运行：

Enter the substring: ooo
Enter the string to search into: Wooooooooow
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