问题是逻辑上的预设。 or 优先级低于 and ，所以你需要把整个 or 带圆括号的条件。
所以基本上改变这个：

WHERE
    pgf.GRADE_ID = paam.GRADE_ID
    AND cs.ASSIGNMENT_ID = paam.ASSIGNMENT_ID
    AND (pgf.name = 'C' AND cs.SALARY_AMOUNT <> '9.00')
    OR (pgf.name = 'D' AND cs.SALARY_AMOUNT <> '9.75')

收件人：

WHERE
    pgf.GRADE_ID = paam.GRADE_ID
    AND cs.ASSIGNMENT_ID = paam.ASSIGNMENT_ID
    AND (
        (pgf.name = 'C' AND cs.SALARY_AMOUNT <> '9.00')
        OR (pgf.name = 'D' AND cs.SALARY_AMOUNT <> '9.75')
    )

内圆括号不是严格需要的（出于上述原因），但它们使意图更清楚。
我还建议重写查询以使用标准的显式连接，而不是老式的隐式连接。顺便说一句，这消除了前相关性问题：

SELECT
    paam.ASSIGNMENT_NUMBER,
    cs.SALARY_AMOUNT,
    pgf.NAME Grade
FROM CMP_SALARY cs
INNER JOIN PER_ALL_ASSIGNMENTS_M paam 
    ON cs.ASSIGNMENT_ID = paam.ASSIGNMENT_ID
INNER JOIN PER_GRADES_F_TL pgf
    ON pgf.GRADE_ID = paam.GRADE_ID
WHERE 
    (pgf.name = 'C' AND cs.SALARY_AMOUNT <> '9.00')
    OR (pgf.name = 'D' AND cs.SALARY_AMOUNT <> '9.75')