您需要创建一个JmsMessageContainerFactory并对其进行相应的配置。Sping Boot 会为您创建一个示例，但您可以根据需要使用自己的自定义创建任意多的示例，并使用@JmsListener注解的containerFactory引用它们。

@Bean
public DefaultJmsListenerContainerFactory jmsListenerContainerFactory(
        ConnectionFactory connectionFactory) {
  DefaultJmsListenerContainerFactory factory = new DefaultJmsListenerContainerFactory();
  factory.setConnectionFactory(connectionFactory);
  factory.setMessageConverter(yourMessageConverter());
  // .. other settings
  return factory;
}

请注意，此处的bean名称是默认名称，因此您不需要指定connectionFactory属性。
Sping Boot 1.4将auto-detect your MessageConverter并将其分配给它自动为您创建的默认工厂。

您可以像这样定义转换器

@Component
public MyConverter implements MessageConverter {
    @Override
    ...toMessage(...)

    @Override
    ...fromMessage(...)

因为您使用@Component对其进行了注解，所以不需要定义JmsTemplate（在其上设置转换器以进行发送）或定义DefaultJmsListenerContainerFactory。
但是要认识到，如果您定义了这两个类，则必须按照Stephane的建议将转换器设置到这两个类上