有几个关于这个问题的google链接帮助我解决了这个问题（我应该在发布之前花更多的时间在google上搜索！）。所以为了解决这个问题，我需要创建一个phpmyadmin数据库，导入create_tables. sql，分配一个拥有完全权限的新用户，然后取消对config.inc.php文件的注解：
/* User used to manipulate with storage */ $cfg['Servers'][$i]['controlhost'] = ''; $cfg['Servers'][$i]['controluser'] = 'phpmyadmin';
并取消以下行注解
/* Storage database and tables */ $cfg['Servers'][$i]['pmadb'] = 'phpmyadmin';个
我还需要从新版本config.sample.inc中添加一些行。有一个很好的链接描述了这个，我想保存，但我必须清除我的浏览器缓存来重新加载localhost/phpMyAdmin，在这样做的过程中，我失去了我的历史记录&那个链接！
我知道这个解释并没有完全描述，但我希望它可以帮助任何人谁得到一个类似的问题后，更新phpMyAdmin.我仍然不知道所有这些功能做什么，但它现在都修复了，谢谢！

由于我的英语不是很好，我用谷歌翻译，所以任何错误我很抱歉;）
你好，我有这个相同的问题和解决方案：
在设置完所有phpmmyadmin之后，您需要在phpmyadmin sql控制台中运行文件“create_tables”，该文件位于：phpmyadmin\sql\create_tables.sql
创建后，您需要配置文件“config.inc“，在phpmyadmin文件夹中找到。在其中，您需要包含以下信息，相当于文件“config.sample.inc“，这是一个示例。

/* User used to manipulate with storage */
$cfg['Servers'][$i]['controlhost'] = 'localhost';
$cfg['Servers'][$i]['controluser'] = 'user';
$cfg['Servers'][$i]['controlpass'] = 'password';

/* Storage database and tables */
$cfg['Servers'][$i]['pmadb'] = 'phpmyadmin';
$cfg['Servers'][$i]['bookmarktable'] = 'pma__bookmark';
$cfg['Servers'][$i]['relation'] = 'pma__relation';
$cfg['Servers'][$i]['table_info'] = 'pma__table_info';
$cfg['Servers'][$i]['table_coords'] = 'pma__table_coords';
$cfg['Servers'][$i]['pdf_pages'] = 'pma__pdf_pages';
$cfg['Servers'][$i]['column_info'] = 'pma__column_info';
$cfg['Servers'][$i]['history'] = 'pma__history';
$cfg['Servers'][$i]['table_uiprefs'] = 'pma__table_uiprefs';
$cfg['Servers'][$i]['tracking'] = 'pma__tracking';
$cfg['Servers'][$i]['designer_coords'] = 'pma__designer_coords';
$cfg['Servers'][$i]['userconfig'] = 'pma__userconfig';
$cfg['Servers'][$i]['recent'] = 'pma__recent';
$cfg['Servers'][$i]['users'] = 'pma__users';
$cfg['Servers'][$i]['usergroups'] = 'pma__usergroups';
$cfg['Servers'][$i]['navigationhiding'] = 'pma__navigationhiding';
$cfg['Servers'][$i]['savedsearches'] = 'pma__savedsearches';

编辑：（@Greeso建议）

对于新版本，还应添加：

$cfg['Servers'][$i]['designer_settings'] = 'pma__designer_settings';
$cfg['Servers'][$i]['export_templates'] = 'pma__export_templates';
$cfg['Servers'][$i]['central_columns'] = 'pma__central_columns';
$cfg['Servers'][$i]['favorite'] = 'pma__favorite';

完成，退出并重新进入会话。

通过一个命令完成工作的快速修复脚本：

curl -O -k https://raw.githubusercontent.com/skurudo/phpmyadmin-fixer/master/pma.sh && chmod +x pma.sh && ./pma.sh

通读此repo link中的实际代码

我发现这个问题还有另一个原因。当您创建pmauser供phpmyadmin使用时，如果您忘记为该用户分配允许修改phpmyadmin数据库的模式权限，您将得到同样的消息。好消息是，如果您使用root或类似权限登录，您可以只允许pmauser选择、插入删除phpmyadmin模式，问题应该得到解决。

这将重新安装phpmyadmin：

sudo dpkg-reconfigure phpmyadmin

原始post

几年后，对于那些想知道如何删除这个恼人的消息而不启用该功能的人，只需在您的配置中添加以下行：

$cfg['PmaNoRelation_DisableWarning'] = true;

对于我来说，数据库phpmyadmin丢失了，你可以在sql/目录下的phpmyadmin安装中找到文件create_tables. sql。你可以使用这个文件来重建你的表。
您可以从命令行导入该sql文件。# mysql -u root < create_tables.sql
小心这可能会覆盖你的数据，不要运行它，直到你移动你的旧phpmyadmin表，如果你已经有一个完整的。