你的例子是对的。

controllers/user/IndexController.php

views/user/index/index.php

然后在IndexController/EditController/UpdateController中，您有actionIndex，如果您运行domain.com/user/index或domain.com/user/edit，它将在当前控制器中执行actionIndex（IndexController或EditController）

domain.com/user/index = domain.com/user/index/index

and 

domain.com/user/edit = domain.com/user/edit/index

不确定是否有其他更有效的方法，但一个有效的将是以下。

• 注意：本示例假设您使用的是https://github.com/yiisoft/yii2-app-advanced，但它也适用于基本应用，只需更改命名空间即可。*

所以，假设我们有一个控制器，我们想把它的一些动作存储到不同的php文件中。

<?php

// frontend\controllers\SiteController.php

namespace frontend\controllers;

use yii\web\Controller;

class SiteController extends Controller {

  public function actions() {
    return [
        'error' => [
            'class' => 'yii\web\ErrorAction',
        ],
        'captcha' => [
            'class' => 'yii\captcha\CaptchaAction',
            'fixedVerifyCode' => YII_ENV_TEST ? 'testme' : null,
        ],
        'hello-world' => [
            'class' => 'frontend\controllers\site\HelloWorldAction',
        ],
    ];
  }

  public function actionIndex() {
      // ...
  }

因此，您可以看到，我们有3个外部操作和一个内部操作。
前两个，是框架的工具，用于生成错误页面和验证码，实际上，它们启发了我的答案。
而第三个，则由我们来定义：

'hello-world' => [
   'class' => 'frontend\controllers\site\HelloWorldAction',
],

因此，我们已经命名了操作，并在一个单独的目录中创建了新的操作类。

<?php

// frontend\controllers\site\HelloWorldAction.php

namespace frontend\controllers\site;

use yii\base\Action;

class HelloWorldAction extends Action {

  public function run($planet='Earth') {
    return $this->controller->render('hello-world', [
        'planet'=>$planet,
    ]);
  }

}

最后，我们的观点是：

<?php

// frontend\views\site\hello-world.php

/* @var $this yii\web\View */

use yii\helpers\Html;

$this->title = 'Hello world page';
?>

<h1>Hello world!</h1>

<p>We're on planet <?php echo Html::encode($planet); ?></p>

并看到它的行动：

更新

在发布答案后，我意识到也许你也可以从另一种技术中受益。
如果您想这样做，前面的答案是好的：Extract actions into individual files .
但是，如果您的应用程序具有一定的大小，也许您应该考虑使用Modules。
您可以手动创建它们或使用Gii生成它们：

生成后，请将其包含在您的配置中：

<?php
    ......
    'modules' => [
        'profile' => [
            'class' => 'frontend\modules\profile\Module',
        ],
    ],
    ......

模块就是这样做的，将应用程序逻辑分组到一个目录、控制器、模型、视图、组件等中。
还有两个提示：
现在要访问您的模块，只需访问http://www.your-site.local/profile/default/index，如您所见，它类似于module/controller/action。
如果你想在模块中生成动作的链接，你可以：

<?php
echo Url::to([
    'profile/default/index',
    'param'=>'value',
]);
?>

同样，如您所见，我们使用module/controller/action作为路由。
最后，如果你在一个模块中，比如说profile/picture/edit，你想从SiteController链接到Contact页面，你可以这样做：

<?php
echo Url::to([
    '//site/contact', 
    'param'=>'value',
]);
?>

注意路由开头的双斜杠//，如果没有它，它将生成指向当前模块profile/site/contact的url。