我在Visual Studio 2017中的一个项目中遇到了非常类似的问题，它给了我同样的TFS消息。我也使用了git。在我的案例中，我需要在发布合并之前手动添加一个注解到提交中。由于我必须手动合并冲突，所以需要一个注解，而不是在没有冲突的合并中自动填充的消息。
我很清楚提交需要注解，但如果我没记错的话，VS 2015会自动填充合并的注解，即使您手动修复了任何合并问题。无论如何，在VS 2017中，当存在已解决的冲突时，您将需要添加一个提交注解。

在Visual Studio中从远程Git存储库执行拉取操作期间发生冲突时，您需要执行手动合并以选择远程或本地版本。单击“接受合并”后，您需要提交此合并操作。您将看到如下图所示的操作。

如果您没有看到这个 windows ，您也可以从暂止变更 windows 认可。您可以看到在变更索引标签下没有任何内容。这是因为您在合并时选择了本机版本。当然，在变更下没有显示任何档案变更。但是您仍然需要认可合并作业。

如果你已经安装了Git for Windows（gitk），你可以打开一个命令窗口，导航到你的repo的本地目录并启动它，然后在File菜单中选择“Start git gui”。此时，你会看到你要提交的合并，你可以在那里进行。然后，无论是从gitk还是返回到Visual Studio，你现在都可以把所有的提交推回到原始位置。

我也遇到了同样的问题。用以下代码修复了它：

git reset --hard HEAD // **WARNING**: this will remove your current work, so better stash/backup it

注意：您可以通过以下方式检查上次提交ID：

git rev-parse HEAD // will display the last commit ID

或

git reset --hard <last_commit_ID>

或

git reset --soft <last_commit_ID> // this will only move the pointer

我使用了一个外部工具，如Fork来中止合并。内部VS似乎没有工作。

我手动删除了
index.lock
.git文件夹中的一个文件，它为我解决了这个问题。

在我的例子中，VS一直显示“ApplyMailboxInProgress”
原因是我从命令行运行了一些错误的命令。我不得不中止它的运行

git am --abort