默认情况下，Maven不会在它构建的JAR文件中捆绑依赖项，当您试图在命令行执行JAR文件时，也不会在类路径中提供这些依赖项。这就是Java VM在试图执行代码时找不到库类文件的原因。
您可以使用-cp参数手动指定类路径上的库，但这很快就会变得很麻烦。
一个更好的解决方案是将库代码“shade”到输出JAR文件中。有一个名为maven-shade-plugin的Maven插件可以做到这一点。你需要在POM中注册它，当你运行mvn package时，它会自动构建一个“uber-JAR”，包含你的类和库代码的类。
要简单地捆绑所有必需的库，请将以下内容添加到POM中：

<project>
  ...
  <build>
    <plugins>
      <plugin>
        <groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
        <artifactId>maven-shade-plugin</artifactId>
        <version>3.4.1</version>
        <executions>
          <execution>
            <phase>package</phase>
            <goals>
              <goal>shade</goal>
            </goals>
          </execution>
        </executions>
      </plugin>
    </plugins>
  </build>
  ...
</project>

完成此操作后，可以重新运行上面使用的命令：

$ mvn package
$ java -cp target/bil138_4-0.0.1-SNAPSHOT.jar tr.edu.hacettepe.cs.b21127113.bil138_4.App

如果您希望进一步配置shade插件，包括哪些JAR，为可执行JAR文件指定一个Main-Class等，请参见maven-shade-plugin site的“示例”部分。

当我尝试运行它时，我得到NoClassDefFoundError
如何运行它？您可能试图在没有正确导入maven类路径的情况下用eclipse运行它。请参见用于将maven与eclipse集成的m2eclipse插件。
要验证您的maven配置是否正确，您可以使用exec plugin运行您的应用：

mvn exec:java -D exec.mainClass=<your main class>

**更新：**首先，关于运行exec:java时的错误，主类是tr.edu.hacettepe.cs.b21127113.bil138_4.App。当谈到类名时，它们（几乎）总是用点分隔。简单的类名只是最后一部分：App。完全限定名是完整的包加上简单的类名，这是当你想运行某个东西时给予maven或java的。你试图使用的是一个源文件的文件系统路径。这是一个完全不同的东西。类名通常直接翻译成类路径中的类文件，在您的特定情况下，所讨论的类文件可能位于target/classes/tr/edu/hacettepe/cs/b21127113/bil138_4/App.class，因为maven编译为target/classes，而java传统上会为每个打包级别创建一个目录。

你原来的问题很简单，你没有把Jacksonjar放在你的类路径上。当你从命令行运行一个java程序时，你必须设置类路径，让它知道它可以从哪里加载类。你已经添加了你自己的jar，但没有添加其他必需的jar。你的评论让我认为你不明白如何手动构建类路径。简而言之，类路径可以有两个内容：包含类文件的目录和包含类文件的jar。包含jar的目录不起作用。有关构建类路径的详细信息，请参阅“Setting the class path“以及java和javac工具文档。
您的类别路径至少需要为，而且不含换行符号：

target/bil138_4-0.0.1-SNAPSHOT.jar:
/home/utdemir/.m2/repository/org/codehaus/jackson/jackson-core-asl/1.9.6/jackson-core-asl-1.9.6.jar:
/home/utdemir/.m2/repository/org/codehaus/jackson/jackson-mapper-asl/1.9.6/jackson-mapper-asl-1.9.6.jar

请注意，Windows上的分隔符是分号（;）.
我很抱歉没有早点注意到它。问题是坐在那里在你原来的职位，但我错过了。

你必须在pom文件中为你的依赖项创建类路径。因此你必须把所有的依赖项复制到一个地方。
Check my blog。

<build>
  <plugins>
    <plugin>
      <groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
      <artifactId>maven-dependency-plugin</artifactId>
      <version>2.1</version>
      <executions>
        <execution>
          <id>copy-dependencies</id>
          <phase>package</phase>
          <goals>
            <goal>copy-dependencies</goal>
          </goals>
          <configuration>
            <outputDirectory>${project.build.directory}/lib</outputDirectory>
            <overWriteReleases>false</overWriteReleases>
            <overWriteSnapshots>false</overWriteSnapshots>
            <overWriteIfNewer>true</overWriteIfNewer>
          </configuration>
        </execution>
      </executions>
    </plugin>
    <plugin>
      <groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
      <artifactId>maven-jar-plugin</artifactId>
      <version>2.4</version>
      <configuration>
        <archive>
          <manifest>
            <addClasspath>true</addClasspath>
            <classpathPrefix>lib/</classpathPrefix>
            <mainClass>$fullqualified path to your main Class</mainClass>
          </manifest>
        </archive>
      </configuration>
    </plugin>
  </plugins>
</build>

这是因为Morphia jar不是输出war/jar的一部分。Eclipse或本地构建将它们作为类路径的一部分，但远程构建或自动/调度构建不将它们视为类路径的一部分。
您可以使用plugin包含依赖jar。
将以下代码段添加到您的pom插件部分

<plugin>
        <artifactId>maven-assembly-plugin</artifactId>
        <version>3.0.0</version>
        <configuration>
            <descriptorRefs>
                <descriptorRef>jar-with-dependencies</descriptorRef>
            </descriptorRefs>
        </configuration>
    </plugin>

由于某种原因，在编译时存在lib，但在运行时缺失。
我的情况是，一个自由党冲突的两个版本。
例如，A依赖于B和C，而B依赖于D：1.0，C依赖于D：1.1，maven可能只导入D：1.0。如果A使用一个在D：1.1中但不在D：1.0中的类，则将引发NoClassDefFoundError。
如果您也处于这种情况，则需要解决相关性冲突。

我可以通过运行mvn install：install-file和-Dpackaging=class来解决这个问题，然后按照here的描述向POM中添加条目：

选择Project -〉Clean应该可以解决此问题