你确定array是你说的吗？如果我把它弄新鲜的：

In [234]: arr = np.array([[1, 0],
     ...: [2, 0],
     ...: [3, 0],
     ...: [4, 0]])

In [235]: arr
Out[235]: 
array([[1, 0],
       [2, 0],
       [3, 0],
       [4, 0]])

您的savetxt运行良好（不需要delimiter参数，因为已将其包含在fmt中）：

In [237]: np.savetxt("file.csv",arr,delimiter=',',fmt='%d,%d')

In [238]: !more file.csv
1,0
2,0
3,0
4,0

你不必使用to_csv。你可能会从自己的代码中受益。从一个numpy数组（或任何其他简单的数据结构）写入一个csv文件只需要几行代码。
一般结构...
使用上下文管理器以写入模式打开文件...

with open('my_csv.csv', 'w') as f:

在其中创建一个循环以遍历数组中的行。
通过将元素转换为字符串并使用另一个循环（或使用join命令）写入，在元素之间使用逗号写入行
写入一个换行符以开始下一行。
给予一试。如果你被卡住了，请评论。