从React Native通信文档中：
项目可以在根目录定义react-native.config.js，并使用CLI选取自定义配置。
例如，下面的配置会通知CLI有关包含iOS文件的源目录。

module.exports = { 
  project: {
    ios: {
      sourceDir: './custom-ios-location',
    },
  },
};

注：在存在多个Podfile文件而CLI选择了错误文件的情况下，您可能会发现此功能非常有用。当发生这种情况时，CLI将打印一条警告，要求您验证其选择。

我也在使用M1，并将我的一个项目的React-Native 0.64.4升级到0.69.5。在所有安装完成后，我在尝试构建IOS时也收到了同样的警告。
我做了一些研究，了解到ruby安装创建的供应商文件夹，在RN项目中我们不需要该文件夹。
简单地说，我删除了供应商文件夹，并试图获得IOS和Android构建。两者都是没有供应商文件夹的工作。
这里有一些讨论：https://www.reddit.com/r/reactnative/comments/taz1k7/vendor_folder_in_new_reactnative_typescript/
但根据React Native Upgrade Helper文档：https://react-native-community.github.io/upgrade-helper/?from=0.64.4&to=0.69.5
.gitignore文件应如下更改

# Ruby / CocoaPods
/ios/Pods/
/vendor/bundle/

因此，供应商文件夹可以留在您的本地，您可以得到警告，而试图获得ios建设，但这不是一个问题，因为在您的建设，您将继续使用您的'ios/Podfile'。

Podfile是在ios文件夹中，这是特定于我们的项目，所以我们不应该删除它。否则，你将无法运行ios项目。现在，如果我们谈论供应商文件夹的podfile，我们可以忽略它。他们可能会使用内部，但它不会影响到我们的项目，而我们做pod安装。所以保持这两个文件。
在.gitignore文件中，我们应该添加以下代码。

# Ruby / CocoaPods
/ios/Pods/
/vendor/bundle/

甚至在这里提到。
我希望这对你有帮助。让我知道它解决了你的疑问吗？