python-3.x 查找 Dataframe 中缺少的行并为列设置NaN的有效方法是什么?

gzszwxb4  于 2022-12-01  发布在  Python
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假设我有一个 Dataframe ,其中第一列是日期时间,其他列是指定日期时间中的数据(每小时收集一次数据,因此每行的第一列都比前一行晚一个小时)。在这个 Dataframe 中,一些日期时间的数据丢失。我想创建一个新的 Dataframe ,其中丢失的行被替换为其他列的相关日期时间和NaN。
我尝试从csv中读取 Dataframe 作为第一个DF,并在循环中创建一个空DF,以按时间顺序为每个小时创建日期时间,然后我从第一个DF中获取数据并将其放入第二个DF,如果第一个DF中没有指定日期时间的数据,我将NaN放入该行。
这对我来说很有效,但是它非常慢,需要3天的时间来运行70000行,我想有一个高效的方法来完成这个任务。
我想有一个更好的方法,如this one,但我需要它的日期时间。
我正在寻找一个类似Replacing one data frame value from another based on timestamp Criterion的答案,但只包含日期时间。

abithluo

abithluo1#

我认为你可以创建一个df,其中你有时间戳作为你的索引。
然后,您可以使用pd.date_range为每小时创建一个完整的日期时间范围(从最小值到最大值)。
然后,您可以运行Index.difference来有效地查找原始 Dataframe 中丢失的任何时间戳--〉这将是具有丢失值的新df的索引。
然后用NaN填写缺失的列

import pandas as pd
import numpy as np

# name of your datetime column
datetime_col = 'datetime'
 
# mock up some data
data = {
    datetime_col: [
        '2021-01-18 00:00:00', '2021-01-18 01:00:00',
        '2021-01-18 03:00:00', '2021-01-18 06:00:00'],
    'extra_col1': ['b', 'c', 'd', 'e'],
    'extra_col2': ['g', 'h', 'i', 'j'],
}

df = pd.DataFrame(data)
 
# Setting the Date values as index
df = df.set_index(datetime_col)
 
# to_datetime() method converts string
# format to a DateTime object
df.index = pd.to_datetime(df.index)
 
# create df of missing dates from the sequence
# starting from min dateitme, to max, with hourly intervals
new_df = pd.DataFrame(
    pd.date_range(
        start=df.index.min(), 
        end=df.index.max(),
        freq='H'
    ).difference(df.index)
)

# you will need to add these columns to your df
missing_columns = [col for col in df.columns if col!=datetime_col]

# add null data
new_df[missing_columns] = np.nan

# fix column names
new_df.columns = [datetime_col] + missing_columns

new_df
vd2z7a6w

vd2z7a6w2#

我不确定我是否完全符合您的要求,即您尝试完成日期时间的频率是多少,但假设是每小时一次,那么您可以尝试以下内容:
1.使用pandas中的pd.date_range(start_date, end_date, freq='H')函数创建一个pandas DataFrame,其中包含您需要的所有缺失的每小时时间(一列,名称与初始DataFrame中的第一列相同)。https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/reference/api/pandas.date_range.html
1.使用pd.merge(initial_df, complete_df, how='outer')函数在两个 Dataframe 之间执行外部合并。如果我没有弄错的话,在初始 Dataframe 中没有日期的所有列都应该默认填充NA。
下面使用Matt的示例重现示例:

import pandas as pd
import numpy as np
 
# mock up some data
data = {
    'date': [
        '2021-01-18 00:00:00', '2021-01-18 01:00:00',
        '2021-01-18 03:00:00', '2021-01-18 06:00:00'],
    'extra_col1': ['b', 'c', 'd', 'e'],
    'extra_col2': ['g', 'h', 'i', 'j'],
}

df = pd.DataFrame(data)
 
# Use to_datetime() method to convert string
# format to a DateTime object
df['date'] = pd.to_datetime(df['date'])
 
# Create df with missing dates from the sequence
# starting from min dateitme, to max, with hourly intervals
new_df = pd.DataFrame(
    {'date': pd.date_range(
        start=df['date'].min(), 
        end=df['date'].max(),
        freq='H'
    )}
)

# Use the merge function to perform an outer merge
# and reorder the date column
result_df = pd.merge(df,new_df,how='outer')
result_df.sort_values(by='date',ascending=True, inplace=True)

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