现在您使用的是fx.existsSync()和fs.readdirSync()，它们都是 synchronous 操作。这意味着代码的其余部分将在这些函数启动后继续运行。
基本上，解释器将启动这些操作，然后在它们运行的同时继续运行它们后面的代码行，因为这些函数指示代码将“同步”或"同时“运行。这意味着它将在启动同步操作后立即运行res.json()行，这显然不是所需的行为。
如果你想等待这些函数完成，你必须结合使用async/await和这些函数的异步版本。这将导致你的代码"异步“运行，这意味着”不同时“，或者”一行接一行“。
请在此处查看文档：

• fs.readdir（）（您想要的）与fs.readdirSync（）（您拥有的）
• fs.stat（）（您可能需要的内容）与fs.existsSync（）（您拥有的内容）

我还没有测试您的代码，但是如果这些新函数的实现与同步版本相同，那么您的新代码可能类似于：

con.query(sql, async function (err, result) {
        if (err) throw err;
        for (let i = 0; i < result.length; i++) {
            //these test arrays are being sent to the client
            result[i].test = ["aaa", "bbb", "ccc"]
            try {
                const exists = await fs.stat(fichiers_observations + result[i].id_observation)
                if (exists) {
                    const files = await fs.readdir(fichiers_observations+result[i].id_observation)
                    result[i].files = [];
                    for (const file of files) {
                        //these URL are not being sent to the client
                        result[i].files.push('a URL/' + file)
                    }
                }
            } catch (err) {
                if (err) throw err;
            }
        }
        res.json(result);
})

或者，您可以找到一种使用更多回调的方法来实现这一点，但使用async/await可能更简洁。

这是最后的代码。await fs.stat总是返回undefined，所以我不得不返回到fs.exists，同时使用await和promisify。现在看起来很简单，但是有很多方法都不起作用，这是一个相当不错的经验。

const readdir = util.promisify(fs.readdir);
const exists = util.promisify(fs.exists);

con.query(sql, async function (err, result) {
    if (err) throw err;
    for (let i = 0; i < result.length; i++) {
        const it_exists = await exists(directory + result[i].id)
        if(it_exists){
            const files = await readdir(directory + result[i].id)
            result[i].files = [];
            for (const file of files) {
                result[i].files.push('a URL/' + file)
            }
        }
    }
    res.json(result)
})