您可以在列上循环并使用pmin：

as.data.frame(lapply(1:ncol(X), \(i) pmin(X[[i]], Y[[i]], Z[[i]])))

如果需要泛化到更多 Dataframe ，我会将它们放在list中，并将do.call与pmin一起使用。
（答案未经测试，因为未提供样本数据。）
更通用的解决方案是将 Dataframe 堆叠到3D阵列中，并使用apply：

arr = abind(A, B, C, along = 3)
result = apply(arr, 1:2, min)

另一个选项是：潮流：

library(purrr)
map_dfc(transpose(df_list), lift(pmin))

data.table:

library(data.table)
rbindlist(df_list, idcol = "group")[,lapply(.SD,min),rowid(group)]

基准R

aggregate(do.call(rbind,df_list), list(sequence(sapply(df_list, nrow))), min)

编辑：

基本R方法：

Reduce(function(x,y)replace(x, x>y , y[x>y]), list_df)