Javascript混淆器文档会直接给予答案。
他们提供a gulp plugin named gulp-javascript-obfuscator，您可能会想使用它。
在您的示例中，您可能会这样写：

const minify = require('gulp-minify');
const JavaScriptObfuscator = require('gulp-javascript-obfuscator');

gulp.task('js', function () {
  return gulp
    .src('js/*.js')
    .pipe(JavaScriptObfuscator())
    .pipe(minify())
    .pipe(gulp.dest('output/'));
});

请尝试在发布这些类型的问题之前研究这些问题，因为StackOverflow认为这些类型的帖子不是“good”。