在这里回答我自己的问题...已经实现了我想要的Git子模块。
我基本上复制了detailed in this sake task的内容，但总的来说：

• 已将docs路径移至缓存文件夹。认可变更。
• 按照常规说明创建了一个干净的gh-pages分支
• 已将临时文件夹中的所有内容移动到新的gh-pages分支中。提交更改。
• 回到master分支，将远程gh-pages作为子模块添加到docs文件夹中。
• 提交更改。瞧！

嗯，我最后写了这两个Makefile目标来推送我的文档。我只是做了update-doc，它通常是有效的。

TMP_PATH="/tmp/some_path"

## the dir containing HTML docs to push to gh-pages
HTML_DIR="html"

## arbitrary dirs created by the doc build system that should be removed
TRASH=latex

update-doc: doc
        rm -rf ${TMP_PATH} && cp ${HTML_DIR} ${TMP_PATH} -R && rm -rf ${HTML_DIR}
        git fetch
        git checkout gh-pages
        cp ${TMP_PATH}/* . -R
        rm -rf ${TRASH}
        git add .
        git commit -m "Update documentation"
        git push -u origin gh-pages
        rm -rf ${TMP_PATH}
        git checkout master

# command to build documentation; can be customised but
# remember to also change the HTML_DIR and TRASH variables
doc:
        doxygen docs/doxygen.conf

.PHONY: doc update-doc

我使用doxygen，但是您可以将其更改为任何其他文档系统。
这假定远程数据库上存在gh-pages分支，并且按照here得说明创建了该分支.

为这些文件创建指向该点的符号链接。你应该也能够提交这些文件。