这个问题的一个可能的原因是pyenv和您在Raspberry Pi上安装的另一个工具之间存在冲突。例如，如果您在系统上安装了另一个版本的Python，则该版本可能会覆盖pyenv创建的目录。
另一个可能的原因是权限问题。如果你用来安装Python的用户帐户没有创建和修改目录的正确权限，这可能会导致目录在创建后被删除。
要解决此问题，您可能需要尝试以下步骤：

• 检查系统中是否安装了其他版本的Python。如果安装了，请尝试卸载它们，然后重新安装要与pyenv一起使用的Python版本。
• 检查~/.pyenv/versions目录的权限。确保你用来安装Python的用户帐户有权限在这个目录中创建和修改文件。
• 尝试安装不同版本的Python，如Python 3.8。这将帮助您确定问题是特定于某些版本的Python，还是所有版本都存在。

如果仍然遇到问题，您可能需要尝试卸载pyenv，然后从头开始重新安装。这将重置pyenv的配置，并可能有助于解决该工具的任何基本问题。