这很可能是因为当您在日期选择器日历打开时导航时，日期选择器'show'事件会多次触发。
在日历已打开时设置禁用日期会导致日历重新计算并重新加载，从而导航回当前选定日期所在的月份-这会导致无法导航离开选定日期所在的页面（未选定日期时会出现半工作场景）。
不确定这是否适用于您的方案，但如果您仅在未打开日历的情况下设置禁用日期，则此方法应该有效。
我变了

.on('show', function(ev){

至

$('.date-picker').on('click', function(ev){

这看起来工作得很好，请参阅更新的小提琴：
https://jsfiddle.net/zj9sjspf/11/
第二个有点“黑客”的解决方案是，您可以禁用自动showOnFocus，并手动检查日历是否没有打开+设置新的禁用日期+当字段被关注时手动触发show。这不是最好的方法，但可能是您等待bug报告回复时的一种方法;）
可以在此处看到一种实现此目的的方法：https://jsfiddle.net/zj9sjspf/13/

我在运行setEndDate和setStartDate时遇到了同样的问题。日期选择器坏了，不能更改月份、年份等，解决方法是这样的：

var setDatesDisabled = false;

$('.datepicker').datepicker({
    // Whatever options
})
.on('show', function(e) {
    if (!setDatesDisabled) {
        $(this).datepicker('setDatesDisabled', ['2016-04-17','2016-04-16']); 
        setDatesDisabled = true;
    }
})
.on('hide', function(e) {
    setDatesDisabled = false;
});

show事件仅在日期选择器打开时运行，而不在导航时运行。