最简单的方法是检查它们是否存在

if (document.getElementById('check_Terrilyn'))
  document.getElementById('check_Terrilyn').checked = true;

编辑

一个更现代的方法，并考虑到有一个未知数量的复选框，可以使用querySelectorAll。
它将返回一个元素列表（NodeList），例如，正如您的代码所建议的，所有复选框的id都以check_开头，您可以将其与attribute selector一起使用，如下所示：
第一次

使用id和if方法

if (document.getElementById('check_Terrilyn')){
    document.getElementById('check_Terrilyn').checked = true;
}

以类的方式接近

//ES6
Array.from(document.getElementsByClassName('commonclass')).forEach(e => {
    e.checked = true;
});

我过去常做

if(document.getElementById('check_Terrilyn')!="null")
    document.getElementById('check_Terrilyn').checked=true;

你可以这样做：

let elm = document.getElementById('check_Terrilyn');

elem && elem.checked = true;

如果你把它们都设置为选中状态，那么通过class选择它们并循环遍历它们，这样即使没有找到也不会有什么影响。
您似乎还在使用jQuery，因此代码可以简化为：

function selectAllStudents() {
  unselectAllStudents();
  let boxes = $(".scores").toArray();
  $('.checkbox').prop('checked', true);
}

因为您已经标记了jquery，所以使用prop

function selectAllStudents() {
    unselectAllStudents();
    let boxes = $(".scores").toArray();
    $('#check_Terrilyn').prop( "checked", true );
    //for the rest of them
}

或者创建一个id数组，在设置它们的checked属性之前，可以迭代并检查它们是否存在

var array = ['check_Terrilyn', 'check_Vinnie']; //add more ids as required
array.forEach( s => $("#"+s).prop( "checked", true ) );

或者用普通的js

var array = ['check_Terrilyn', 'check_Vinnie']; //add more ids as required
var fnGetEl = (id) => document.getElemetById(id);
array.forEach( s => {
  var el = fnGetEl(s);
  if(el)
  {
    el.checked = true;
  }
});

我看到你已经在使用jQuery了。为什么不完全使用它，停止使用getElementById呢？
只要执行$( ... ).prop('checked',true)即可。jQuery将处理未找到元素的情况。

function selectAllStudents() {
    unselectAllStudents();
    let boxes = $(".scores").toArray();
    $('#check_Terrilyn, #check_Vinnie, #check_Boren, #check_Tempie, #check_Mapes, #check_Fletcher, #check_Bovee, #check_Figgs').prop('checked',true);
}

if(document.getElementById("id_selector2teller")){
alert("id_selector2teller exists");
}else{
alert("id_selector2teller not available");
}

如果你想检查元素是否存在，同时把它赋给一个变量（如果元素不存在，就把它设为'false'），这是可行的：

var check_Terrilyn = document.getElementById('check_Terrilyn') ?
                     document.getElementById('check_Terrilyn').checked : false;