事实证明，我在渲染器进程中使用了keytar，我把keytar移到了主进程中（它不经过Webpack / Babel），并被electron-builder正确打包。
main.js

ipcMain.on('get-password', (event, user) => {
    event.returnValue = keytar.getPassword('ServiceName', user);
});

ipcMain.on('set-password', (event, user, pass) => {
    event.returnValue = keytar.replacePassword('ServiceName', user, pass);
});

然后从渲染器进程调用

const password = ipcRenderer.sendSync('get-password', user);

或

ipcRenderer.sendSync('set-password', user, pass);

window.require("electron").remote.require("keytar")

因为您正在使用渲染器进程，并且希望使用来自系统或主进程的本机API。

更新日期：

我发现（根据OP），转换我的主线程代码（使用keytar）导致调用返回TypeError: keytar.findPassword is not a function的keytar函数。
我不得不使用webpack-asset-relocator-loader来成功地捆绑keytar：

npm i -DE @vercel/webpack-asset-relocator-loader

将以下规则添加到webpack.config.js中：

module: {
  rules: [{
    test: /\.node$/,
    parser: { amd: false },
    use: {
      loader: "@vercel/webpack-asset-relocator-loader",
      options: {
        outputAssetBase: "native_modules"
      }
    }
  },
  // <other rules>
  ],
  // rest of config
}

在此Github问题中找到解决方案。
下面的信息仍然代表在您的Webpack构建中包含二进制资源。
如果您必须转换需要二进制文件的代码，您可以将file-loader添加到您的webpack配置中。

安装

npm i -D file-loader
或
yarn add -D file-loader

Webpack配置（包括一个.dat文件）

...,
module: {
  rules: [{
    ...
  }, {
    test: /\.dat$/,
    use: {
      loader: "file-loader"
    }
  }]
},
...

如果要保留文件名，可以将name选项传递给加载器：

use: {
  loader: "file-loader",
  options: {
    name: "[name].[ext]"
  }
}

有关file-loader Github repo的更多信息。