np.nonzero(theta)返回非零值的索引。在您的示例中，它返回：
[1,2,3]
然后，theta[np.nonzero（theta）]返回值
[1,2,3]
当您对上一个输出执行np.argmin(theta[np.nonzero(theta)])时，它会返回值1的索引0。
因此，正确的方法是：
i,j = np.where( theta==np.min(theta[np.nonzero(theta)]))其中i,j是原始numpy数组的最小非零元素的索引
theta[i,j]或theta[i]给出该索引处的相应值。

#!/usr/bin/env python

# Solution utilizing numpy masking of zero value in array

import numpy as np
import numpy.ma as ma
a = [0,1,2,3]
a = np.array(a)

print "your array: ",a

# the non-zero minimum value
minval = np.min(ma.masked_where(a==0, a)) 
print "non-zero minimum: ",minval

# the position/index of non-zero  minimum value in the array
minvalpos = np.argmin(ma.masked_where(a==0, a))  
print "index of non-zero minimum: ", minvalpos

我认为你@艾米丽非常接近正确答案。你说：
np.argmin(theta[np.nonzero(theta)])给出了一个零索引，这显然是不正确的。我认为这是因为它首先创建了一个非零元素的新数组。
最后一句是正确的=〉第一句是错误的，因为它应该给予新数组中的索引。
现在，让我们从旧（原始）数组中提取正确的索引：

nztheta_ind = np.nonzero(theta)
k = np.argmin(theta[nztheta_ind])
i = nztheta_ind[0][k]
j = nztheta_ind[1][k]

或：

[i[k] for i in nztheta_ind]

对于原始数组任意维数。

ndim溶液

i = np.unravel_index(np.where(theta!=0, theta, theta.max()+1).argmin(), theta.shape)

解释
1.屏蔽掉零会创建t0。还有其他方法，请参见性能图。
1.查找最小位置，返回展平（1D）索引。

1. unravel_index修复了此问题，尚未建议使用。

theta = np.triu(np.random.rand(4,4), 1)  # example array

t0 = np.where(theta!=0, theta, np.nan)   # 1
i0 = np.nanargmin(t0)                    # 2
i = np.unravel_index(i0, theta.shape)    # 3

print(theta, i, theta[i])                #

掩码：i = np.unravel_index(np.ma.masked_where(a==0, a).argmin(), a.shape)
名称：i = np.unravel_index(np.nanargmin(np.where(a!=0, a, np.nan)), a.shape)
最大值：i = np.unravel_index(np.where(a!=0, a, a.max()+1).argmin(), a.shape)