我在一个脚本中有一些非常奇怪的行为，我写了很多年，但是由于某种原因，无法在一个特定的文件上运行。
由于意识到脚本无法识别应该在散列中的键，我添加了一些测试打印语句来读取这些键。我的常规策略是在变量前后放置星号，以检测潜在的隐藏字符。显然，这些键已经损坏。相关代码块：

foreach my $fastaRecord (@GenomeList) {

    my ($ID, $Seq) = split(/\n/, $fastaRecord, 2);

# uncomment next line to strip everything off sequence
# header except trailing numeric identifiers
#    $ID =~ s/.+?(\d+$)/$1/;

    $Seq =~ s/[^A-Za-z-]//g; # remove any kind of new line characters

    $RefSeqLen = length($Seq);

    $GenomeLenHash{$ID} = $RefSeqLen;

    print "$ID\n";

    print "*$ID**\n";

}

这会产生下列输出：

supercont3
**upercont3
Mitochondrion
**itochondrion
Chr1
**hr1
Chr2
**hr2
Chr3
**hr3
Chr4
**hr4

通常，我会怀疑其中涉及到“非法”换行符。然而，我手动替换了输入文件中的所有换行符，试图解决这个问题。输入文件中的什么可能导致脚本以这种方式执行？我可以想象，尽管我做了很多努力，ID变量后面仍然有一个非法换行符，但为什么第一个星号，也不打印双星号后面的换行符，为什么在行首打印双星号的方式会覆盖第一个星号以及变量“value”的前两个字符？