如果您想使用Windows主文件夹作为MSYS 2的主文件夹，您可以编辑/etc/nsswitch.conf并写入：

db_home: windows

Msys 2将使用windows %HOME%作为它的$HOME目录。如果你在环境变量中设置%HOME%（到你需要Msys 2使用的windows目录），它将工作。

我更喜欢只更新/etc/fstab@fstab。

# cat /etc/fstab
# For a description of the file format, see the Users Guide
# https://cygwin.com/cygwin-ug-net/using.html#mount-table

# DO NOT REMOVE NEXT LINE. It remove cygdrive prefix from path
none / cygdrive binary,posix=0,noacl,user 0 0
##################################################################
# Canonicalize the two home directories by mounting the windows  #
# user home with the same path mapping as unix.                  #
##################################################################
none /c/Users/Edward /home/Edward binary,posix=0,noacl,user 0 0

在其中一个shell启动脚本（例如~/.bash_profile，其中~是默认/原始主目录）中，您可以更改$HOME环境变量：

export HOME=/something/else

如果你想在那个目录下打开你的shell，你可能需要在设置$HOME之后运行cd（没有参数）;我还没有测试过。

除了以上的回答，还有一种方法是使用Windows命令mklink来创建目录符号链接，类似于Linux的ln。
首先创建e:\msys\home目录，然后以管理员身份运行cmd，然后运行：

cd c:\msys64
mklink /j home e:\msys\home

不需要其它改变。
有时在特定的基础更新后，链接无效，需要在清除或重命名新生成的“home”目录后再次创建。

创建或修改MSYS2 /etc/passwd文件。下面显示了两种方法。
以下命令可以从MSYS2 shell运行，并且无论文件是否存在以及是否已包含当前用户，都可以安全地运行：

$ grep "^${USERNAME}:" /etc/passwd >/dev/null 2>&1 || mkpasswd | grep "^${USERNAME}:" >>/etc/passwd

接下来，编辑/etc/passwd，并更改相关用户的主目录字段（第6个冒号分隔的字段）。

$ vim /etc/passwd

附加功能：也可以通过编辑第一个字段来更改MSYS2用户名。
根据需要，将当前主目录内容移动到新的主目录。
注销，然后重新登录。
/etc/passwd编辑可以在没有手动编辑的情况下完成，但是这使得粘贴到MSYS2 shell的命令行更加复杂，并且，如果/etc/passwd文件已经存在并且其中已经有用户名，则它可能不起作用：

__DIR="/path/to/home"
mkpasswd | grep "^${USERNAME}:" | \
awk -v DIR="${__DIR}" -v RS=":" -v ORS="/n" \
'NR == 6 { printf(DIR ":"); next } { printf("%s", $0) } NR < 7 { printf(":") }' - >>/etc/passwd

我已经创建了一个批处理文件来设置HOME变量：

set HOME=C:\Users\%USERNAME%
C:\LocalApp\PortableGit\git-bash.exe

这允许我把我的.bash_profile放在这个HOME中（而不是放在执行速度非常慢的默认网络位置）。