您尝试执行的操作在使用Maven或Gradle时无法执行，原因是创建工件（由于您使用的是Sping Boot ，因此很可能是jar）时，根目录中只有一个application.properties文件。
我建议您更改支持模块上的属性文件的名称，然后配置Sping Boot 来查找该文件（查看this或this指针答案），或者为您的构建工具使用某种类型的合并任务（可能类似于this）

这个问题正是@geoand所描述的。Spring boot加载顶级application.properties，并忽略其他jar中任何同名的属性文件。
但我没有找到任何具体的实现如何解决这个问题，所以这里是为那些谁想要知道的实现。
请考虑以下项目配置：

+main_module
  +src
    +main
      +java
        +my/package/Application.java
      +resources/application.properties
+module_aa
  +src
    +main
      +java
        +my/package/config/ModuleAAConfig.java
      +resources/module_aa.properties
+module_bb
  +src
    +main
      +java
        +my/package/config/ModuleBBConfig.java
      +resources/module_bb.properties

现在，为了正确加载每个子模块的属性，我们需要在每个模块的配置上添加@PropertySource注解，即ModuleAAConfig.java, ModuleBBConfig.java。
示例：
ModuleAAConfig.java

package my.package.config;

@Configuration
@PropertySource(
    ignoreResourceNotFound = false,
    value = "classpath:module_aa.properties")
public class ModuleAAConfig {}

ModuleBBConfig.java

package my.package.config;

@Configuration
@PropertySource(
    ignoreResourceNotFound = false,
    value = "classpath:module_bb.properties")
public class ModuleBBConfig {}

• • 奖金：**

如果您想加载配置文件特定的属性，您可以通过使用Spring变量来完成，例如：

@PropertySource("classpath:module_aa-${spring.profiles.active}.properties")

Sping Boot 按照以下顺序读取属性文件。（摘自Spring Boot in Action）
1.在外部，位于运行应用程序的目录的/config子目录中
1.在外部，位于运行应用程序的目录中
1.在内部，位于名为“config”的包中
1.在内部，位于类路径的根目录
该列表按优先级排序（在列表中较高位置定义的特性将覆盖在较低位置定义的特性）。
因此，将application.properties放在config子目录中将给予它更高的优先级。在以下配置中，来自module_a的application.properties将优先。您可以在application.properties中添加公共默认值，并通过将配置文件放在config/application.properties中在单个模块中覆盖它们。

+common_module
  +src
    +main
      +java
      +resources/application.properties
+module_a
  +src
    +main
      +java
        +my/package/Application.java
      +resources/config/application.properties

您还可以使用spring.config.location环境属性（逗号分隔的目录位置或文件路径列表）引用显式位置

$ java -jar myproject.jar --spring.config.location=classpath:/default.properties,classpath:/override.properties

有关click的更多信息，请单击此处

作为一个选项，您可以更正确地设计您的模块，并实现EnvironmentPostProcessor来自动加载它们的个人属性文件。
请看我的详细回答：如何application.properties在Spring中继承www.example.com？

在同一工件中不可能有多个application.properties，但可以有

application.properties 
 application.yml

在相同的工件中。这可能有助于分离关注点。