我最近开始使用snakemake，想在我的snakefile中运行一个shell脚本。但是，我在访问input，output和params时遇到了麻烦。我将非常感谢您的建议！
以下是相关代码片段：
1.从我的蛇文件

rule ..:
    input:
        munged = 'results/munged.sumstats.gz'
    output:
        ldsc = 'results/ldsc.txt'
    params:
        mkdir = 'results/ldsc_results/',
        ldsc_sumstats = '/resources/ldsc_sumstats/',
    shell:
        'scripts/run_gc.sh'

1.和脚本：

chmod 770 {input.munged}
mkdir -p {params.mkdir}

ldsc=$(ls {params.ldsc_sumstats})
for i in $ldsc; do
...

我收到以下错误消息：

...
chmod: cannot access '{input.munged}': No such file or directory
ls: cannot access '{params.ldsc_sumstats}': No such file or directory
...