让我们举例说明您的自定义配置。

NSString *jScript = @"var meta = document.createElement('meta'); meta.setAttribute('name', 'viewport'); meta.setAttribute('content', 'width=device-width'); document.getElementsByTagName('head')[0].appendChild(meta);";

WKUserScript *wkUScript = [[WKUserScript alloc] initWithSource:jScript injectionTime:WKUserScriptInjectionTimeAtDocumentEnd forMainFrameOnly:YES];

//Here you can customize configuration
[self.webView.configuration.userContentController addUserScript:wkUScript];

// self.webView.navigationDelegate = self;
// self.webView.contentMode = UIViewContentModeScaleAspectFill;

您可以在Storyboard中创建WKWebView，然后使用WKUIDelegate:createWebViewWith创建新的WKWebView（仅使用配置）。

class WindowViewController: UIViewController {
    
    // The WKWebView created from storyboard
    @IBOutlet var webView: WKWebView!
    
    override func viewDidLoad() {

        // Delegate the webview's uiDelegate
        self.webView.uiDelegate = self
    }
}

extension WindowViewController: WKUIDelegate {
    
    func webView(_ webView: WKWebView, createWebViewWith configuration: WKWebViewConfiguration, for navigationAction: WKNavigationAction, windowFeatures: WKWindowFeatures) -> WKWebView? {

        // Create new WKWebView with custom configuration here
        let configuration = WKWebViewConfiguration()
        
        return WKWebView(frame: webView.frame, configuration: configuration)
    }
}

是的！！！我们可以设置WKWebViewConfiguration的WKWebView从笔尖或故事板我使用下面的代码：
这是我的IBOutlet--

@IBOutlet  var webViewChat: WKWebView!

//使用下面的代码可以设置配置

webViewChat.configuration.userContentController.add(self, name: "edit")
 webViewChat.configuration.userContentController.add(self, name: "remove")

**注意：**确保在设置配置后加载URL

由于WKWebView的配置属性是只读的，因此无法通过WKWebView的出口从故事板中设置WKWebView的配置，相反，我们需要按如下所示进行编程配置。

class ViewController: UIViewController, WKScriptMessageHandler {

    @IBOutlet weak var webContentView: UIView!
    var webView: WKWebView?

    let contentController = WKUserContentController()        
    contentController.add(self, name: "callbackHandler")

    let configuration = WKWebViewConfiguration()
    configuration.userContentController = contentController

    self.webView = WKWebView(frame: self.webContentView.bounds, configuration: configuration)
    self.webContentView.addSubview(self.webView!)
}

并实现WKScriptMessageHandler委托方法

func userContentController(_ userContentController: WKUserContentController, didReceive message: WKScriptMessage) {
    if (message.name == "callbackHandler"){
        print("\(message.body)")
    }
}

希望这能帮上忙...

我的答案并不能解决所有人的问题，但是一定要检查情节提要中的WKWebView的属性检查器，看看是否可以在那里设置您想要对配置进行的更改。
我刚刚花了一个小时试图用代码来解决这个问题，当时我所要做的就是在属性检查器中选中2个框。

对于目标C：

WKWebViewConfiguration *config = _webView.configuration;
WKUserContentController* ctrl = [[WKUserContentController alloc] init];
[ctrl addScriptMessageHandler:self name:@"method1"];
[ctrl addScriptMessageHandler:self name:@"method2"];
// others ... 
config.userContentController = ctrl;

并添加WKScriptMessageHandler的实现：

- (void)userContentController:(WKUserContentController *)userContentController didReceiveScriptMessage:(WKScriptMessage *)message{
NSLog(@"userContentController:didReceiveScriptMessage: message=%@", message);
if ([message.name isEqualToString:@"method1"] && message.body
//        &&[message.body isKindOfClass:[NSString class]]
    ) {
        // do something
    } else if ([message.name isEqualToString:@"method2"] && message.body
        ) {
        // do something
    }
}