我已经解决了这个问题5分钟后，我已经张贴的问题...但我相信这可能是有用的人在未来，因为它是一个相当陷阱，所以我会离开它。问题出在我的SmallCppProject里面。2它有.git目录，而在那个目录里面有与repo相关的符号链接。3那些符号链接被破坏了，因为当我'我复制了这个项目，目录被改变了。显然这是一个问题，因为在删除.git目录之后，现在一切都很好。尽管我认为opengrok应该为这样的事情做好“准备”，忽略断开的链接。

编辑：实际上这不是关于符号链接的问题，而是关于.git目录的问题，所以最新的opengrok docker映像显然有问题，当前版本是1.7.2，通常如果我只放源代码，opengrok就可以工作，但是如果我把源代码加到git，opengrok就不能初始化了。

如果您仔细查看日志，可能会发现OpenGrok无法将本地git仓库与远程git仓库同步，原因是缺少git密钥或git用户名和密码。
如果你的源代码包含git文件夹，OpenGrok可以自动执行git pull，并保持你的git仓库是最新的。但如果没有配置git密钥或用户名/密码，它只会记录错误并跳过索引项目，我认为这不是一个好的设计。
正确的解决方案是让OpenGrok禁用自动同步。
打开Docker容器的cli窗口，通过cd转到“/opengrok/etc”。此文件夹中存在mirror.yml文件。请执行以下命令：

echo "project:
  .* :
    disabled: true
">mirror.yml

并重新启动容器。
OpenGrok将忽略所有包含.git文件夹的项目的同步。如果您只是想禁用某个项目的自动同步，请将“.*”替换为您要忽略的项目名称。

编辑：

用NOMIRROR=“yes”启动opengrok docker container可以简单地解决这个问题。运行以下命令：

docker run -d -v /home/testuser/OpenGrokTest/:/opengrok/src -p 8080:8080 -e NOMIRROR="yes" opengrok/docker:latest