在R 4.0.0之前安装了程序包“XXX”:请重新安装

uyto3xhc  于 2023-01-15  发布在  其他
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我使用的是R4.0.2。
我从cfcdaehere手动安装了2个包。我按照here的说明下载了Rtools并使用它安装了上面的包。
问题是

writeLines('PATH="${RTOOLS40_HOME}\\usr\\bin;${PATH}"', con = "~/.Renviron") # runs fine
Sys.which("make") #works fine
                               make 
"C:\\rtools40\\usr\\bin\\make.exe" 
install.packages("Stat5303libs_0.7-5.zip",repos=NULL,type="source") # these all run fine
install.packages("cfcdae_0.8-4.zip",repos=NULL,type="source")  # these all run fine

然而,当我遇到下面的问题时,我试图运行库.

Error: package or namespace load failed for ‘cfcdae’:
 package ‘cfcdae’ was installed before R 4.0.0: please re-install it

我在下面试了试,但还是没有用。

update.packages(ask=FALSE, checkBuilt=TRUE)

为什么会这样?是因为 Package 太旧了吗?

    • 更新日期:**

根据要求,我已经改变了我的.libPaths()如下,并更新了SessionInfo()以及。

> .libPaths()
[1] "C:/Users/UserME/Documents/R/win-library/4.0"
[2] "C:/Program Files/R/R-4.0.2/library"   

R version 4.0.2 (2020-06-22)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 18363)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_Hong Kong SAR.1252  LC_CTYPE=English_Hong Kong SAR.1252   
[3] LC_MONETARY=English_Hong Kong SAR.1252 LC_NUMERIC=C                          
[5] LC_TIME=English_Hong Kong SAR.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_1.0.4.6        rstudioapi_0.11     magrittr_1.5       
 [4] splines_4.0.2       MASS_7.3-51.6       tidyselect_1.1.0   
 [7] munsell_0.5.0       statmod_1.4.34      lattice_0.20-41    
[10] colorspace_1.4-1    R6_2.4.1            rlang_0.4.6        
[13] minqa_1.2.4         dplyr_1.0.0         tools_4.0.2        
[16] grid_4.0.2          nlme_3.1-148        gtable_0.3.0       
[19] ellipsis_0.3.1      lme4_1.1-23         tibble_3.0.1       
[22] lifecycle_0.2.0     numDeriv_2016.8-1.1 crayon_1.3.4       
[25] Matrix_1.2-18       nloptr_1.2.2.2      purrr_0.3.4        
[28] ggplot2_3.3.2       vctrs_0.3.1         glue_1.4.1         
[31] compiler_4.0.2      pillar_1.4.6        generics_0.0.2     
[34] scales_1.1.1        boot_1.3-25         lmerTest_3.1-2     
[37] pkgconfig_2.0.3
vyswwuz2

vyswwuz21#

所有的软件包都需要在新的version(4. 0)下重新安装。我不得不先删除然后重新安装所有的软件包。
以下几点对我很有效:

# check your package library path 
.libPaths()

# grab old packages names
old_packages <- installed.packages(lib.loc = "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library")
old_packages <- as.data.frame(old_packages)
list.of.packages <- unlist(old_packages$Package)

# remove old packages 
remove.packages( installed.packages( priority = "NA" )[,1] )

# reinstall all packages 
new.packages <- list.of.packages[!(list.of.packages %in% installed.packages()[,"Package"])]
if(length(new.packages)) install.packages(new.packages)
lapply(list.of.packages,function(x){library(x,character.only=TRUE)})
eivnm1vs

eivnm1vs2#

当R从旧目录(例如,R 4.0.x之前的目录)阅读时,可能会发生此问题。
以下是一些可能的解决方法:

  • 检查您的.libPaths()- R可能正在从R 3.x.x库阅读包,这会产生您所得到的错误。或者,尝试创建一个新的库目录(这很可能会解决这个问题)。
  • update.packages(ask=FALSE, checkBuilt=TRUE)(您已经尝试过)
  • 删除以前安装的R及其相关目录。
brc7rcf0

brc7rcf03#

zip文件是一个预先构建的用于Windows的 binary 包,而不是源代码包。使用install.packages(*, type="source")安装它不会有什么不同。您需要联系编写这些包的人,以便为R 4.0重新构建它们,或者向您提供真实的的源代码A-这通常是一个.tar.gz文件。

deyfvvtc

deyfvvtc4#

如果你在使用renv的时候遇到了这个问题,你可能需要检查一下你的renv缓存,我不得不删除我的缓存,以迫使我的项目使用新安装的包版本而不是旧的。

huus2vyu

huus2vyu5#

在类似的情况下,我将“site-library”重命名为“old-site-library”,创建了一个新的空“site-library”文件夹,并成功地从那里继续操作。

lmvvr0a8

lmvvr0a86#

如果有人在运行revdepcheck::revdep_check()时遇到这个错误消息,我的做法是删除R包目录中的/revdep/文件夹。

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