R语言 ggplot条形图中的水平白色

wkyowqbh 于 2023-01-15 发布在其他

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当我使用ggplot2和geom_col()或geom_bar(stat = 'identity')从R保存一个图形时，它会出现一些难看的水平白线。
数据如下所示：

> head(mouse_track_data)
session site BM.pile ox.pile       type  mice skinks geckos 
1 dec_2018    1       1    1.10 control FALSE   TRUE  FALSE            
2 dec_2018    1       2    1.12 design1 FALSE  FALSE  FALSE           
3 dec_2018    1       3    1.11 control FALSE  FALSE  FALSE            
4 dec_2018    1       4    1.80 control FALSE  FALSE  FALSE            
5 dec_2018    1       5    1.60 design1 FALSE  FALSE  FALSE            
6 dec_2018    1       6    1.50 control FALSE  FALSE  FALSE

下面是我的代码：

ggplot(data = mouse_track_data, aes(x = session, y = as.numeric(mice), fill = type)) + 
  geom_bar(stat='identity') +
  theme_classic() +
  theme(text = element_text(size=15),
        axis.text.x = element_text(angle = 45, hjust = 1)) +
  xlab("Tracking session") +
  ylab("Number of tunnels with mouse tracks") +
  theme(axis.title.y = element_text(margin = margin(t = 0, r = 7, b = 0, l = 0))) +
  theme(axis.title.y = element_text(margin = margin(t = 0, r = 7, b = 0, l = 0)))  +
  theme(legend.title = element_blank(), legend.position = c(-2, -2)) +
  scale_fill_manual(values = c("control" = "#37a1c1", "design1" = "#9ce2cb", "design2" = "#445a9c"),
                    labels = c(" Control", " Single grade", " Mixed grade")) +
  scale_x_discrete(labels = c('Dec 2019', "April 2019", "Nov 2019", "March 2020")) +
  scale_y_continuous(breaks=seq(0, 50, 10), limits = c(0,52), expand = c(0,0)) +
  theme(axis.line = element_blank())

有了这个，或者使用geom_col()，当导出为ESP或PDF时，我会得到一个如下所示的图：

所有的列上都有细白线。我想这是和它计算每个数据点然后把它们堆积起来有关的吧？
如果我用geom_bar()来做代码，它没有白线，但是它没有按照我想要的方式显示数据。

来源：https://stackoverflow.com/questions/64055988/horizontal-white-lines-in-ggplot-bar-graph

2条答案

按热度按时间

webghufk1#

当你使用geom_col()时，你会得到每个数据值的一个条形段，这会产生白色，下面的例子以夸张的方式显示了这一点。

library(tidyverse)

mtcars %>%
  mutate(cyl = factor(cyl), am = factor(am)) %>%
  ggplot(aes(x = cyl, y = 1, fill = am)) +
  geom_col(color = "white")

最简单的解决方法是手动聚合，例如使用group_by()和summarize()：

mtcars %>%
  mutate(cyl = factor(cyl), am = factor(am)) %>%
  group_by(cyl, am) %>%
  summarize(count = n()) %>%
  ggplot(aes(x = cyl, y = count, fill = am)) +
  geom_col(color = "white")
#> `summarise()` regrouping output by 'cyl' (override with `.groups` argument)

由reprex package（v0.3.0）于2020年9月26日创建

注：geom_col()与geom_bar(stat = "identity")相同。

赞(0）回复(0）举报 2023-01-15

4xrmg8kj2#

你也可以把同样的变量添加到aes的color参数中，这样你的aes调用就变成了：
aes(x = session, y = as.numeric(mice), fill = type, color = type))
您还必须具有相同的填充和颜色比例，因此添加：
scale_color_manual(values = c("control" = "#37a1c1", "design1" = "#9ce2cb", "design2" = "#445a9c"), labels = c(" Control", " Single grade", " Mixed grade"))
ggplot 2使用fill参数填充列/条形图，使用color参数为列/条形图的轮廓着色。如果不指定轮廓颜色，可能会出现白色，正如您所观察到的。指定相同的轮廓和填充颜色可以避免您看到的问题。如Claus Wilke所建议的，预聚合在某些情况下会有所帮助。但不总是这样。例如，如果你有数千种填充颜色，你最终还是会得到白色，不管是不是预先聚合的。

赞(0）回复(0）举报 2023-01-15

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