我有同样的问题，修改你的代码有帮助。一个问题是“woocommerce_available_shipping_methods”过滤器从WooCommerce 2.1中被弃用。所以你必须使用新的：“woocommerce_package_rates"。类似的任务也有WooCommerce tutorial。
因此，我修改了filter hook，当条件为真时，我迭代所有的运输方式/费率，找到我想向客户显示的方式，从中创建新数组并返回该数组（只有一个项目）。
我认为你的问题（除了不赞成的钩子）主要是错误的unset（$available_methods[...]）行。它不能像那样工作。
下面是我的代码：

add_filter( 'woocommerce_package_rates', 'hide_shipping_based_on_class' ,    10, 2 );
function hide_shipping_based_on_class( $available_methods ) {
    if ( check_cart_for_share() ) {
        foreach($available_methods as $key=>$method) {
            if( strpos($key,'YOUR_METHOD_KEY') !== FALSE ) {
                $new_rates = array();
                $new_rates[$key] = $method;
                return $new_rates;
            }
        }
    }
    return $available_methods;
}

警告！我发现woocommerce_package_rates钩子不是每次都被触发，而是只有当您更改购物车中的项目或项目数量时才被触发。或者对我来说是这样。也许这些可用的价格以某种方式缓存了购物车内容。

下面的代码片段允许您隐藏基于航运类的航运方式。详细说明可here

add_filter('woocommerce_package_rates', 'wf_hide_shipping_method_based_on_shipping_class', 10, 2);

function wf_hide_shipping_method_based_on_shipping_class($available_shipping_methods, $package)
{
$hide_when_shipping_class_exist = array(
    42 => array(
        'free_shipping'
    )
);

$hide_when_shipping_class_not_exist = array(
    42 => array(
        'wf_shipping_ups:03',
        'wf_shipping_ups:02',
         'wf_shipping_ups:01'
    ),
    43 => array(
        'free_shipping'
    )
);

$shipping_class_in_cart = array();
foreach(WC()->cart->cart_contents as $key => $values) {
   $shipping_class_in_cart[] = $values['data']->get_shipping_class_id();
}

foreach($hide_when_shipping_class_exist as $class_id => $methods) {
    if(in_array($class_id, $shipping_class_in_cart)){
        foreach($methods as & $current_method) {
            unset($available_shipping_methods[$current_method]);
        }
    }
}
foreach($hide_when_shipping_class_not_exist as $class_id => $methods) {
    if(!in_array($class_id, $shipping_class_in_cart)){
        foreach($methods as & $current_method) {
            unset($available_shipping_methods[$current_method]);
        }
    }
}
return $available_shipping_methods;
}