使用each（）循环示例化表，并将它们存储在数组中：

$(document).ready(function() {
        var tables = [];

    $("table").each(function(i){
     var table = $(this).DataTable({
        "aaSorting": [],
        "scrollX": true,
        "scrollY": 530,
        "scrollCollapse": true,
        "lengthMenu": [
            [100, 400, 1000, 5000, -1],
            [100, 400, 1000, 5000, "All"]
        ],
        "retrieve": true
    });
    tables.push(table);
    });

    $('#button').click( function () {
        // Then you can call destroy on that object
        var elem = tables[0].table().node();
        tables[0].destroy();
        // And empty the element
        $(elem).empty()
    } );
} );

链接到jsFiddle

不能在$(document).ready()中同时创建和销毁DataTable，因为这些事件是同时触发的。请参见@CMedina的JSfiddle，他在其中展示了它们在由（比如）按钮单击触发时的工作情况。（假设它们在同一个文件中）忽略这一部分;显然它们是不同的文件。
请注意，您在注解中提到创建/销毁在不同的文件中。如果确实如此，销毁文件是如何知道table的？如果它不知道DataTable（也可能是由于在该页面上没有包含脚本文件），那么它将不知道destroy()的功能，并抛出错误。

**编辑：**我刚刚注意到您尝试在table上使用destroy()，然后在table[0]上使用destroy()。您不能让table既是DataTable又是DataTable的数组。请尝试在数组中唯一地命名您的表或同时命名这两个表;或者

var table;
table[0] = $('#example').DataTable();
table[1] = $('#example2').DataTable();

或者（可能更好）

var table1 = $('#example').DataTable();
var table2 = $('#example').DataTable();

我假设您的页面中有2个数据表，并且您的初始化是针对类为.dynamic-wide-table的所有表。
如果只销毁一个表，则应使用tables函数获取页面中的所有数据表。
然后对指定表应用销毁：（在我的示例中使用2个数据表）。

$(document).ready(function() {
var table = $(".dynamic-wide-table").DataTable({
    "aaSorting": [],
    "scrollX": true,
    "scrollY": 530,
    "scrollCollapse": true,
    "lengthMenu": [
        [100, 400, 1000, 5000, -1],
        [100, 400, 1000, 5000, "All"]
    ],
    "retrieve": true
});

$('#destroy1').click( function () {
    var dt1 = $.fn.dataTable.tables()[0];
    $(dt1).DataTable().destroy();
} );

$('#destroy2').click( function () {
 var dt2 = $.fn.dataTable.tables()[1];
    $(dt2).DataTable().destroy();
} );
} );

结果：https://jsfiddle.net/cmedina/7kfmyw6x/80/

我有同样的问题。虽然只有一个表在我的页面，但我会得到错误：

Uncaught (in promise) TypeError: tbl.destroy is not a function

我的原因是因为没有像这样初始化dataTable：

let tbl = $('#myTable').DataTable();

我把它写成：

let tbl = $('#myTable').dataTable();

请注意用大写字母D书写.DataTable。