使用rpy2将NA_character_导入Python后未将其标识为NaN

yeotifhr 于 2023-01-28 发布在 Python

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我在一个R magic单元格中使用以下代码：

%%R -o df

library(tibble)

df <- tibble(x = c("a", "b", NA))

然而，当我在另一个单元格（Python单元格）中运行时：

df.isna()

我得到

x
1  False
2  False
3  False

实际上，导入的 Dataframe 是

x
1              a
2              b
3  NA_character_

如何将NA_character_转换为Python NaN？
我试过了

df.replace('NA_character_', np.nan)

但没有成功。

来源：https://stackoverflow.com/questions/75223099/na-character-not-identidied-as-nan-after-importing-it-into-python-with-rpy2

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按热度按时间

ykejflvf1#

正如您在注解中所指出的，R NA_character_值没有转换为np.nan，而是具有不同的类型rpy2.rinterface_lib.sexp.NACharacterType，在这种情况下，解决方案只是迭代该列并将此类型转换为np.nan：

import rpy2 # if you haven't already
df['x'] = df['x'].apply(lambda val: np.nan if isinstance(
    val, rpy2.rinterface_lib.sexp.NACharacterType) 
    else val
)

至于这是否是一个bug，3.3.0版的changes声明：
panda Series中的值nan现在转换为R NA（问题#668）。
然而，相反的情况似乎并没有发生，我不知道这是否意味着它是一个bug，一个设计决策，或者仅仅是它还没有被实现。

赞(0）回复(0）举报 2023-01-28

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