使用factominer和factoextra包/库的PCA分析

hmae6n7t  于 2023-01-28  发布在  其他
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library(factoextra)
library(FactoMineR)

res.pca = PCA(clin.oc[,1:14], graph = TRUE)
scree = fviz_screeplot(res.pca, ncp=5, addlabels=TRUE, size=0.5, title='Scree 
plot')
loadings = plot(res.pca, choix = "var", title='Loadings')

n = fviz_contrib(res.pca, choice = "var", axes = 1, top = 5, title='Variable 
contributions')
scores = fviz_pca_ind(res.pca, label="none", habillage=as.factor(clin), 
                      tittle='scores')
ggarrange(scree, loadings, n, scores)

并且ggarange函数不起作用,表示未找到。

zxlwwiss

zxlwwiss1#

我认为这个错误已经在res.pca中了,因为你的'identifier'变量是字符类型的。五氯苯甲醚(临床文献[,2:14],...)。

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