我不能理解你的问题100%，但我认为下面的解决方案将为您配置liquibase的多个类路径的工作
我觉得做下面的结构是个好主意：

--src
   -- main
     -- resources
       -- changelogs
          -- migrations1.xml
          -- migrations2.xml
          -- ...
          -- migrationsN.xml
       -- migrations.xml (it's a master changeLog which includes all the other changeLogs)

尝试设置子changeLog文件的相对路径，如下所示：
<includeAll path="/changelogs" relativeToChangelogFile="true"/>
在includeAll文档的第一个链接中，有一部分是关于为什么使用它不是一个很好的实践
尽管includeAll标记有很多有价值的用途，但它的使用可能会导致问题。最需要避免的是使用includeAll标记来模拟Ruby on Rails的活动迁移策略，即一系列更改（每个文件一个更改），这些更改按文件顺序运行。虽然这起初看起来是个好主意，但很快就会遇到问题
如果您确实选择使用includeAll标记，请确保您有一个适当的命名策略，以确保您永远不会有冲突或需要重命名文件以进行更改来强制重新排序。
因此，也许您可以考虑使用<include>标记并列出所有子changeLog文件。
例如：

<include path="changelogs/migrations1.xml" relativeToChangelogFile="true"/>
<include path="changelogs/migrations2.xml" relativeToChangelogFile="true"/>
...etc.

我可以提供一个我已经找到的解决方案。我遇到了一个与您描述的类似的问题，我在Liquibase community中详细描述了这个问题。我使用的是liquibase版本4.3.2和Gradle插件2.0.3。
在我的示例中，我使用了一个包含mysql.sql文件的.xml主文件

./src
└── main
    ├── java
    └── resources
        ├── application.properties
        └── db
            └── changelog
                ├── init
                │   ├── 1-0-table.mysql.sql
                │   └── 1-0-view.mysql.sql
                └── master.xml

master.xml

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>   
<databaseChangeLog  
  xmlns="http://www.liquibase.org/xml/ns/dbchangelog"  
  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance"  
  xsi:schemaLocation="http://www.liquibase.org/xml/ns/dbchangelog
                      http://www.liquibase.org/xml/ns/dbchangelog/dbchangelog-3.8.xsd">  

  <include  file="init/1-0-table.mysql.sql"
            relativeToChangelogFile="true" />

  <include  file="init/1-0-view.mysql.sql"
            relativeToChangelogFile="true"
            context="!test"/>

</databaseChangeLog>

在移动到包含.yml文件的.yml master之后，我已经能够运行更新，而不会与类路径前缀发生任何冲突，尽管类路径前缀只在Spring中使用。

./src
└── main
    ├── java
    └── resources
        ├── application.properties
        └── db
            └── changelog
                ├── init
                │   ├── 1-0-table.yml
                │   └── 1-0-view.yml
                └── master.yml

master.yml

databaseChangeLog:
  - include:
      file: init/1-0-table.yml
      relativeToChangelogFile: true
  - include:
      file: init/1-0-view.yml
      relativeToChangelogFile: true
      context: "!test"

但是如果我使用插件命令（例如changelogSync），路径需要来自src，例如：
要解决此问题，您可以在Gradle运行的Liquibase任务中配置类路径基目录。
这将确保在去除此基本路径后相对路径匹配：
/源代码/主/资源/db/changelog/changelog.yml=db/changelog/changelog.yml
此外，它还解决了 * 明确指出"Build.Gradle"中的changlogFile后 * 迁移复制的问题
完整配置应如下所示（适用于您的情况）：

liquibase {
  activities {
    main {
        File propsFile = new File("${project.rootDir}/src/main/resources/liquibase.properties")
        Properties properties = new Properties()
        properties.load(new FileInputStream(propsFile))
        changeLogFile properties['changeLogFile']
        url properties['url']
        username properties['username']
        password properties['password']
        classpath "${projectDir}/src/main/resources"
     }
  }
}