由于列名（id和name）不明确，您的代码按但是的方式工作，值与预期不符。
以下是调试时的结果（注意用户ID是500和501，而不是1和2，以便更好地突出显示问题），断点位于适当的位置，并且使用：-

findById(500)

然后调试器显示：-

也就是说，尽管John的部门ID是3，但在部门本身中却是500，同样，部门名称是***John Doe***，而不是预期的*Human Resource。
这是因为Room不知道哪个id代表什么，同样也不知道name。
修复方法是使用唯一的列名，例如：-

@Entity(tableName = "department")
data class Department(
    @PrimaryKey(autoGenerate = true)
    @ColumnInfo(name = "dept_id")
    var id: Long,
    @ColumnInfo(name = "dept_name")
    var name: String
 )

• 例如，表中的列已更改，但部门中的列未更改。您可以只将字段的名称更改为唯一名称。

显然，如果列名发生变化，则SQL必须相应地进行更改，因此：-

@Query("SELECT * FROM user " +
        "INNER JOIN department ON department_Id = dept_id " +
        "WHERE id = :id")
fun findById(id: Long): Map<User, Department>

• 由于列名称现在没有歧义，所以不需要使用表名来区分（你仍然可以。2没有表巴内斯，SQL可以更简洁。

现在调试显示：-

其他重新编辑

如果部门是在用户内部组成的，是否可以？
如果您在@Entity注解类（包含在@Database注解类的entities参数中）中使用@Embedded，则生成的表将具有与嵌入类相同的列。
如果嵌入的类以前是一个表，那么就不存在的关系而言，以前的表很可能是失效的。
嵌入的Department存在一个问题，因为您将有两列名为id
从数据库的Angular 来看，如果是一对多关系，则相同的数据（例如人力资源）将重复，这与标准化相反。
关于这个问题

@Query("SELECT * FROM user " +
    "INNER JOIN department d ON department.id = d.id " +
    "WHERE id = :id")
fun findById(id: Long): Map<User, Department>

那么这将不起作用，因为没有department表（因为根据您的代码，Department类没有用@Entity注解）。

正如官方文档中所描述的，房间从2.4版本开始就支持这个功能。与您类似的问题似乎也在这个答案https://stackoverflow.com/a/72990697/5473567中得到了解决
在你的具体例子中，你忘记了关系是1：N，因此你在DAO函数中的返回类型应该看起来像Map<User, List<Department>>。
SELECT中的department.name AS 'department_name'也是错误的。data class Department中的字段name名为name，因此在数据库表department中，此字段也将名为name。如果要将其名称更改为SELECT中使用的department_name，你必须使用注解@ColumnInfo，如下所示：

@Entity(tableName = "department")
data class Department(
    @PrimaryKey(autoGenerate = true) var id: Long,
    @ColumnInfo(name = "department_name") var name: String
)

最后一个提示，如果您正在从数据库中提取完整的数据，那么有足够的数据可以使用SELECT * FROM...，Room将为您解决这个问题。
最后，整个DAO接口可能看起来像这样：

@Dao
interface UserDAO {
    @Query("SELECT * FROM user " +
        "INNER JOIN department ON user.department_id = department.id " +
        "WHERE user.id = :id")
    fun findById(id: Long): Map<User, Department>
}

解决了。根据答案，下面是我的解决方案，不使用额外的数据类，同时保持列名不变，例如在每个表中使用不带任何前缀的id列（更可取）。我不得不在WHERE子句中使用user.id以避免歧义

• • 用户**

@Entity(tableName = "user")
data class User(
    @PrimaryKey (autoGenerate = true) 
    var id: Long,
    var username: String,
    var name: String,
    var department_id: Long)

• • 部门**

@Entity(tableName = "department")
data class Department(
    @PrimaryKey(autoGenerate = true)
    var id: Long,
    var name: String)

• • DAO查询**

@Query("SELECT * FROM user " +
        "INNER JOIN department ON user.department_id = department.id " + // fixed from user.id = department.id
        "WHERE user.id = :id")
fun find(id: Long): Map<User, Department>