唯一应该开箱即用的事情是测试gcc版本，并希望这在所有架构上都能一致地完成。
不过这并不能保证，我最近遇到了一个类似的问题，不是内置函数的问题，而是线程本地存储的__thread的问题。这在一些体系结构（linux）上实现，但在其他体系结构（OS X，bsd？）上没有实现，而且没有办法用宏来发现这一点。
如果你有gnu make，你可以做一些类似的事情来检测你的Makefile中是否存在一个特定的函数：

__THREAD := $(shell echo '__thread int i;' | ${CC} ${CFLAGS} -xc -c -o /dev/null - 2> /dev/null || echo "NO")
ifeq (${__THREAD},NO)
${warning thread local storage (TLS) with '__thread' is not supported, switching to pthread_getkey}
CFLAGS += -D__GNUC_NO_TLS__
endif

这避免了使用更复杂的配置实用程序。

#ifdef指令检查__builtin_ctzll是否定义为一个 * 宏 * 名称，它不会帮助您确定__builtin_ctzll * 函数 * 是否存在。
我对gcc内置函数的了解还不够，无法提供比这更多的帮助：内在的东西怎么会不见了呢

在clang的最新版本中，现在可以使用__has_builtin()宏来检查内置的intrinsic是否存在。

int popcount(int x)
{
#if __has_builtin(__builtin_popcount)
  return __builtin_popcount(x);
#else
  int count = 0;
  for (; x != 0; x &= x - 1)
    count++;
  return count;
#endif
}

希望GCC将来也能支持__has_builtin()。

GCC现在（最近几年）支持__has_builtin：它于2020年5月7日在GCC 10.1中引入。
另外，感谢@Charles评论，找到错误报告here