我敢打赌，当你试图用一个新的值来替换现有因子水平之外的值时，问题就出现了：

levels(iris$Species)
# [1] "setosa"     "versicolor" "virginica"

你的例子很糟糕，但这很有效：

iris$Species[iris$Species == 'virginica'] <- 'setosa'

这更有可能造成您在自己的数据中看到的问题：

iris$Species[iris$Species == 'virginica'] <- 'new.species'
# Warning message:
# In `[<-.factor`(`*tmp*`, iris$Species == "virginica", value = c(1L,  :
#   invalid factor level, NAs generated

如果您首先提高因子水平，它将起作用：

levels(iris$Species) <- c(levels(iris$Species), "new.species")
iris$Species[iris$Species == 'virginica'] <- 'new.species'

如果你想用“物种B”代替“物种A”，你最好用

levels(iris$Species)[match("oldspecies",levels(iris$Species))] <- "newspecies"

对于您建议的内容，您可以使用levels更改级别：

levels(iris$Species)[3] <- 'new'

您可以使用plyr包中的revalue函数替换因子向量中的值。
在示例中，将因子virginica替换为setosa：

data(iris)
 library(plyr)
 revalue(iris$Species, c("virginica" = "setosa")) -> iris$Species

我也遇到过同样的问题。这样效果更好：
确定要修改的级别：levels(iris$Species)

"setosa" "versicolor" "virginica"

因此，setosa是第一个。
然后，写这个：

levels(iris$Species)[1] <-"new name"

使用dlpyr::mutate和forcats::fct_recode：

library(dplyr)
library(forcats)

iris <- iris %>%  
  mutate(Species = fct_recode(Species,
    "Virginica" = "virginica",
    "Versicolor" = "versicolor"
  )) 

iris %>% 
  count(Species)

# A tibble: 3 x 2
     Species     n
      <fctr> <int>
1     setosa    50
2 Versicolor    50
3  Virginica    50

一种更通用的解决方案可同时处理所有数据框，且无需添加新的因子水平，该解决方案为：

data.mtx <- as.matrix(data.df)
data.mtx[which(data.mtx == "old.value.to.replace")] <- "new.value"
data.df <- as.data.frame(data.mtx)

这段代码的一个很好的特性是，你可以一次为原始数据框赋值，而不是一个"new.value"，而且新值可以是随机值，这样你就可以创建一个与原始数据框大小相同的完整的新随机数据框。

您希望替换数据集列中的值，但却收到如下错误：
因子水平无效，生成NA
试试这个：
levels(dataframe$column)[levels(dataframe$column)=='old_value'] <- 'new_value'

如果你必须替换多个值，并且你不介意用as.factor（as.character（...））“重构”你的变量，你可以尝试以下方法：

replace.values <- function(search, replace, x){
  stopifnot(length(search) == length(replace))
  xnew <- replace[ match(x, search) ]
  takeOld <- is.na(xnew) & !is.na(x)
  xnew[takeOld] <- x[takeOld]
  return(xnew)
}

iris$Species <- as.factor(search=c("oldValue1","oldValue2"),
                          replace=c("newValue1","newValue2"),
                          x=as.character(iris$Species))

水平（虹膜$物种）
含量（虹膜$种）[3]〈- '刚毛'