我正在寻找类似的信息，但没有找到，所以我在Visual Studio 2010和MSBuild 4.0附带的.targets文件中做了一些挖掘。我认为这是寻找将执行转换的MSBuild任务的最佳位置。
就我所知，使用了以下MSBuild任务：

<Project ToolsVersion="4.0"
         DefaultTargets="Deploy"
         xmlns="http://schemas.microsoft.com/developer/msbuild/2003">

    <UsingTask TaskName="TransformXml"
               AssemblyFile="$(MSBuildExtensionsPath)\Microsoft\VisualStudio\v10.0\Web\Microsoft.Web.Publishing.Tasks.dll"/>

    <PropertyGroup>
        <ProjectPath>C:\Path to Project\Here</ProjectPath>
        <DeployPath>C:\Path to Deploy\There</DeployPath>
        <TransformInputFile>$(ProjectPath)\Web.config</TransformInputFile>
        <TransformFile>$(ProjectPath)\Web.$(Configuration).config</TransformFile>
        <TransformOutputFile>$(DeployPath)\Web.config</TransformOutputFile>
        <StackTraceEnabled>False</StackTraceEnabled>
    </PropertyGroup>

    <Target Name="Transform">
        <TransformXml Source="$(TransformInputFile)"
                      Transform="$(TransformFile)"
                      Destination="$(TransformOutputFile)"
                      Condition="some condition here"
                      StackTrace="$(StackTraceEnabled)" />
    </Target>
</Project>

我已经测试了上面的代码，可以确认它是有效的。您可能需要稍微调整一下结构，以便更好地适应您的构建脚本。

您应该能够通过使用Package目标并指定temp目录来完成此操作。

msbuild solution.sln /p:Configuration=Release;DeployOnBuild=true;DeployTarget=Package;_PackageTempDir=..\publish

http://pattersonc.com/blog/index.php/2010/07/15/visual-studio-2010-publish-command-from-msbuild-command-line/

或者，您可以尝试使用XDT转换工具：
https://github.com/greenfinch/ctt
我用这个来代替模糊的msbuild目标。可以和*app.config*一起使用，而不仅仅是web.config。

它对我起作用，但有以下更改

<MSBuild Projects="$(ProjectFile)"
         Targets="ResolveReferences;_WPPCopyWebApplication"
     Properties="WebProjectOutputDir=TempOutputFolder;OutDir=$(WebProjectOutputDir);Configuration=$(Configuration);" />

从MsBuild文件夹下的Microsoft.WebApplication.targets文件

_CopyWebApplication

This target will copy the build outputs along with the 
content files into a _PublishedWebsites folder.

This Task is only necessary when $(OutDir) has been redirected
to a folder other than ~\bin such as is the case with Team Build.

The original _CopyWebApplication is now a Legacy, you can still use it by 
 setting $(UseWPP_CopyWebApplication) to true.
By default, it now change to use _WPPCopyWebApplication target in
 Microsoft.Web.Publish.targets.   
It allow to leverage the web.config trsnaformation.

我不是MSBuildMaven，但我能够使用此链接中的信息完成相同的任务：
http://www.hanselman.com/blog/ManagingMultipleConfigurationFileEnvironmentsWithPreBuildEvents.aspx
在文章的底部附近有一个与MSBuild相关的部分。希望这能有所帮助。

另一个答案这个主题后，我一直在寻找几天前，我处理这个问题：

• • 您的发布配置文件和配置名称应匹配。**

在我的例子中，我没有。通过发布配置文件手动发布给了我想要的结果，因为我的配置是在发布配置文件中设置的。然而，MSBuild试图变得智能化，并基于名称神奇地连接发布配置文件和配置。（在命令中添加/p：Configuration会导致关于引用项目的输出路径的其他奇怪错误）。
只是为了明确我的意思：

• • 命令行中的MSBuild语句**

msbuild我的项目. csproj-t：清理-t：重新生成/p：生成时部署= true/p：发布配置文件="开发"

• • 工程**
• • 发布配置文件名称 *：发展
• • 解决方案配置名称 *：发展
• • 不起作用**
• • 发布配置文件名称 *：发展
• • 解决方案配置名称 *：开发

希望这有帮助!