它一点也不完美，但我还是希望它总比没有好。
as_labeller()和labeller()的使用可能会得到你所需要的。

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最简单的解决方案是将Species和var拆分为两个labellers函数。

facet_labeller_top <- function(variable, value) {
  c(
    "Setosa", 
    "",
    "",
    "",
    "Versicolor", 
    "",
    "",
    "",
    "Virginica", 
    "",
    "",
    ""
  )
}

facet_labeller_bottom <- function(variable, value) {
  c(
    "Petal.Length", 
    "Petal.Width",
    "Sepal.Length",
    "Sepal.Width",
    "Petal.Length", 
    "Petal.Width",
    "Sepal.Length",
    "Sepal.Width",
    "Petal.Length", 
    "Petal.Width",
    "Sepal.Length",
    "Sepal.Width"
  )
}

结果：

ggplot(dat) +
  geom_point(aes(x = 1, y = val)) +
  facet_wrap(Species~var, labeller = labeller(Species=as_labeller(facet_labeller_top),
                                              var = as_labeller(facet_labeller_bottom)))

数据示例：

library(tidyr)
library(ggplot2)

dat <- iris %>%
  gather(var, val, Sepal.Length:Petal.Width)

我不知道我是否理解的很好，但我会尝试：
可以使用facet_grid代替facet_wrap
这是密码：

data(iris)
library(tidyr)
library(ggplot2)

dat <- iris %>%
  gather(var, val, Sepal.Length:Petal.Width) 

ggplot(dat) +
  geom_point(aes(x = 1, y = val)) +
  facet_grid(Species~var)

这就是结果：