由于首选项文件名的更改，应用程序不会记住每次运行的首选项

也许我可能是错的，但显然你是试图使用Preferences类来保存目录（例如，用户可以选择一个目录来导出/导入文件，然后所选的目录将被用作默认目录）。你是否试图只创建userRoot而不创建prefs？

private final Preferences user = Preferences.userRoot();
    
    String defaultString = "defaultString";
    String preferenceDirectory = this.user.get(defaultStr, null);
    if(preferenceDirectory != null){
        File defaultInitialDirectory = new File(preferenceDirectory);
        fileChooser.setInitialDirectory(defaultInitialDirectory);
    }

像这样，应用程序将记住目录或任何其他您需要的首选项。我也同意@MadProgrammer的观点，即prefsiderxml文件是技术性的，仅供系统使用。