经过一番折腾，我找到了一个解决办法。这个想法是重新创建有问题的副本。
步骤：
1.获取现有分区分配使用：

./kafka-reassign-partitions.sh \
  --generate --broker-list "1,2,3" \
  --topics-to-move-json-file ./topics-to-generate.json \
  --bootstrap-server <PUT_BOOTSTRAP_SERVERS_HERE>

其中topics-to-generate.json文件为：

{
  "topics": [
    {"topic": "__consumer_offsets"}
  ],
  "version":1
}

1.使用步骤1的输出，通过删除有问题的副本及其日志目录（在我们的示例中，它是代理3上的分区13）来更新有问题的分区：

...
        {
            "topic": "__consumer_offsets",
            "partition": 12,
            "replicas": [3,1,2],
            "log_dirs": ["any","any","any"]
        },
        {
            "topic": "__consumer_offsets",
            "partition": 13,
            "replicas": [1,2],
            "log_dirs": ["any","any"]
        },
        {
            "topic": "__consumer_offsets",
            "partition": 14,
            "replicas": [2,3,1],
            "log_dirs": ["any","any","any"]
        },
...

1.应用新配置：

./kafka-reassign-partitions.sh \
  --reassignment-json-file ./new-partitions-assignment.json \
  --execute \
  --bootstrap-server <PUT_BOOTSTRAP_SERVERS_HERE>

（执行后，可以通过将--execute替换为--verify来查看状态）
1.等待磁盘大小下降
1.使用步骤1中的原始配置恢复原始分区分配：

./kafka-reassign-partitions.sh \
  --reassignment-json-file ./original-partitions-assignment.json \
  --execute \
  --bootstrap-server <PUT_BOOTSTRAP_SERVERS_HERE>