如果你不需要flask中的django-y内容或django中的flak-y内容（即它们完全是独立的应用程序），那么只需设置Web服务器，将对/flaskapp的请求代理到运行Flask的进程，并将/下的其他内容代理到运行Django的进程。
我从来没有在生产环境中这样做过，也从来没有特别地将Django和Flask放在一起，但我经常使用NodeJS开发服务器和Django（或Flask）后端API来代理所有对/api/的请求到我运行Django开发服务器的本地主机上的任何端口。
实现此目的的nginx配置示例：

upstream django {
    # your usual django config using e.g. uwsgi or gunicorn
}

upstream flask {
    # your usual flask config
}

server {
    location / {
        proxy_pass http://django;
    }

    location /flaskapp {
        proxy_pass http://flask;
    }
}

@davidism在评论中提出了一个很好的观点，让Flask知道它并不“拥有”网站根目录。将script_root设置为/flaskapp应该可以做到这一点（参见相关的Flask文档）。