看起来matplotlib并不适合拍摄交互式数据可视化，包括像感兴趣区域绘制这样的功能。当然，它确实处理事件处理等。
到目前为止，我所能想到的最好的是一个名为guiqwt的令人印象深刻的成果，它基于PyQwt，此外还有一个（相当容易满足）的依赖性。快速浏览一下他们的图像可视化测试示例，可以看到一个方便的工具集。安装和运行这些示例非常容易。时间会告诉我融入自己的工作是多么容易。

现在matplotlib有一个很好的小部件叫做“LassoSelector”，它使得自由多边形的绘制变得非常容易。
示例代码如下：http://matplotlib.org/examples/widgets/lasso_selector_demo.html
我的简约版本：

from pylab import *
from matplotlib.widgets import LassoSelector

fig, ax = plt.subplots()
ax.imshow(np.random.randint(0,255,(255,255)), cmap='gray')

def onselect(verts):
    print verts

lasso = LassoSelector(ax, onselect)

subplots_adjust(left=0.1, bottom=0.1)

我想你可以使用PyQTGraph来实现这个目的，https://launchpad.net/pyqtgraph。我很少使用它，因为它比matplotlib有更少的固有选项，但是它非常快，而且它确实有一些内置的小部件来选择你感兴趣的ROI。你可能会发现自己构建了自定义的绘图例程，将matplotlib和PyQTGraph合并在一起。这可能会导致头痛，如果格式不同，等等。它可以导致更多的簿记，但可能会解决您的问题。

2023年：你一定要看看mpl_interactions

您需要的是here，它也可以与 * jupyter-notebook * 配合使用。
官网举例：

参考：https://mpl-interactions.readthedocs.io（上次访问时间：2023年2月28日）

jdoepfert在github上提供了一个很好的工具，可以做你想要做的事情，在我的机器上性能有点慢，但是如果你注解掉motion_notify_event，它就像一个魅力。