既然你已经知道numbers[0][0] = 3的语法，就使用它吧。循环应该经过myArray的indices和每个内部数组的indices。

for (outerIndex in myArray.indices) {
    for (innerIndex in myArray[outerIndex].indices) {
        myArray[outerIndex][innerIndex] = (1..4).random()
    }
}

或者，如果您更喜欢forEach：

myArray.indices.forEach { outerIndex ->
    myArray[outerIndex].indices.forEach { innerIndex ->
        myArray[outerIndex][innerIndex] = (1..4).random()
    }
}

注意不要在数组上使用forEach，这会覆盖数组的 elements，但是数组的原始元素对你没有任何用处，因为这样做的目的是用随机值填充数组。
实际上，你也可以用随机值初始化数组，如下所示：

val myArray = Array(row) { 
    IntArray(col) { (1..4).random() } 
}

myArray.set(i, random)

这个调用不起作用的原因很明显，myArray的类型是Array<IntArray>（所以它有点像Array<Array<Int>>），所以，当期望IntArray时，不能设置Integer。
要修复它（我使用命名参数使它更清楚），您需要使用forEachIndexed：

fun fillArray(myArray: Array<IntArray>) {
    myArray.forEach { outerArray ->
        outerArray.forEachIndexed { innerIndex, _ ->
            val random = (1..4).random()
            
            outerArray.set(innerIndex, random) // we should use different syntax ("Should be replaced with indexing")
            outerArray[innerIndex] = random // this is proper syntax
        }
    }
}