R语言如何给矩阵图中的点着色？

5n0oy7gb 于 2023-03-05 发布在其他

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我用R生成了种群间按距离划分的隔离图。在这种图中，x轴表示地理距离，y轴表示一对种群之间的遗传距离（即每个点对应于由一定地理距离和一定遗传距离分开的一对种群）。为了产生该图，我使用两个矩阵，一个给出了每对种群的地理距离，另一个给出了每对种群的遗传距离，因此我的矩阵在列和行中都有种群的名称。
我生成一个简单的图：plot(Dgeo[lower.tri(Dgeo)], Dgen[lower.tri(Dgen)], xlab = "d_geo", ylab = "d_gen", pch=20, cex=.5, col="cadetblue4", ylim =c(0, 1))
我的每个种群都是三个种群中某个地理分布区域的一部分，我的目标是根据一个条件来给这些点着色：如果被比较的两个种群来自相同的地理分布区，则对应于该对的点具有某种颜色;如果其中一个群体来自地理区域A，另一个群体来自地理区域B，则该点具有另一种颜色;等等。你知道如何用R编写这个代码吗？我很感激你们花时间一起思考这个问题。
再见
我曾尝试创建一个像另外两个矩阵一样的矩阵，其中每个条件包含不同的字母，并且我使用了参数col = my_colour_matrix，但没有成功

r

来源：https://stackoverflow.com/questions/75617345/how-to-colour-the-points-of-a-plot-generated-with-matrices

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按热度按时间

a14dhokn1#

生成一个颜色矩阵cols，其中包含与数据矩阵维度相同的分布区域交互作用，然后使用这些矩阵进行绘图。

玩具数据

set.seed(42)
cols <- matrix(colors()[sample(600, 20)], nrow=5)
dd <- matrix(sample(20), nrow=5)
de <- matrix(sample(20), nrow=5)

plot(dd[lower.tri(dd)], de[lower.tri(de)], 
  xlab = "d_geo", ylab = "d_gen",  pch=19, cex=2, col=cols[lower.tri(cols)])

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