当文件中只有一个标记时,R循环不工作[已关闭]

olhwl3o2  于 2023-03-05  发布在  其他
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我正在计算一个标记的不同等位基因的等位基因中位数。我写了一些R代码,当我在文件中有一个以上的标记时,它们工作正常,但当我只有一个标记时,它们不工作,并给出NA值,而不是所有三个等位基因的中位数。

allelic_median <- data.frame()
for (i in seq_along(Sig_Hmap_fil$Marker)){
  Allele1 <- row.names(Hmap2[Hmap2[i] == as.character(Sig_Hmap$A1[i]),])
  Het <- row.names(Hmap2[Hmap2[i] == as.character(Sig_Hmap$Het[i]),])
  Allele2 <- row.names(Hmap2[Hmap2[i] == as.character(Sig_Hmap$A2[i]),])
  a <- median(na.omit(myY[myY$Sample %in% Allele1, as.character(Sig_Hmap_fil$Trait[i])]))
  b <- median(na.omit(myY[myY$Sample %in% Het, as.character(Sig_Hmap_fil$Trait[i])]))
  c <- median(na.omit(myY[myY$Sample %in% Allele2, as.character(Sig_Hmap_fil$Trait[i])]))
  allelic_median <- rbind(allelic_median, data.frame(A1_median = a, Het_median = b, A2_median = c))
}

代码在〉1个标记的情况下工作正常,但在Sig_Hmap_fil文件中只有一个标记时写入NA。谢谢,

arknldoa

arknldoa1#

Out <- vector('numeric', length(s))
for(i in 1:3) Out[i] <- mean(s[[i]])

输出:

Out
  [1] 7 3 6

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