将R发光页面导出为PDF

qnakjoqk  于 2023-03-05  发布在  其他
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我有一个大型的Shiny应用程序,它有许多提示符,然后根据这些输入生成表格和绘图。我没有使用rmarkdown或knitr或任何东西来格式化输出。我只使用标准的Shiny元素(sidebarPanelmainPanel,对于图和表,我使用标准的React式renderPlotrenderTable对象。我正在寻找一种简单的方法,有一个按钮称为“导出到PDF”将页面上的元素导出到PDF文档。
我已经研究过使用knitr和rmarkdown来生成一个格式奇特的文档(请参见herehere示例),问题是似乎需要在Rmd文件或服务器.R中的downloadHandler对象中重新生成表和图,我希望避免这种情况。
是否有任何方法可以更容易地将页面输出为pdf。更具体地说,是否有任何方法可以直接从Rmd文件中引用输出表格和绘图(即output$对象),以便绘图和表格不需要生成两次?
编辑:这是一些简化的代码。注意getDataset()是一个React函数,它基于输入查询数据库。我的目标是添加一个“Export”按钮,用于导出已经生成的图和表。(另外,作为一个旁注,是否有任何方法可以获得一个在所有React元素之间共享的React数据集?也就是说,不需要在每个对象中都有ds <- getDataset()?)
服务器

output$hist <- renderPlot({
  ds <- getDataset()
  # do data transformations
    
  ggplot(ds, aes(val)) +
    geom_histogram(binwidth = binSize, aes(fill = ..count..)) +
    labs(title = "val dist", x = "val", y = "Count") + 
    scale_fill_gradient("Count", low = "green", high = "red", guide = FALSE) +
    scale_x_continuous(limits = c(min(ds$val), quantile(ds$val, 0.99))) +
    geom_hline(yintercept=maxY, linetype=3)
})

output$time <- renderPlot({
  ds <- getDataset()
  # do data transformations
  ggplot(ds, aes(as.POSIXlt(unixTime, origin="1970-01-01", tz="UTC"), val), colour = val) +
    scale_y_continuous(limits = c(min(ds$val), quantile(ds$val, 0.99))) +
    labs(title = "Val Over Time", x = "Time (UTC)", y = "val (ms)") +
    geom_point(alpha = 0.3, size = 0.7) +
    geom_smooth()
})
output$stats <- renderTable({
  statsDf = getDataset()
  # do data transformations
  statsDf
})

用户界面

ui <- fluidPage(
  titlePanel("Results"),

  sidebarLayout(
    sidebarPanel(
      dateInput("startDateTime", "Start Date:", value = "2016-10-21"),
      textInput("startTime", "Start Time", "00:00:00"),
      br(),
      dateInput("endDateTime", "End Date:", value = "2016-10-21"),
      textInput("endTime", "End Time", value = "02:00:00"),
      br(),
      submitButton("Submit")
    ),
    mainPanel(
      tabsetPanel(type = "tabs",
                  tabPanel("Plots",
                           plotOutput("hist"),
                           plotOutput("time"),
                  tabPanel("Statistics", tableOutput("stats"))
      )
    )
  )
)
67up9zun

67up9zun1#

首先,你应该真正地产生一个可复制的例子,而不仅仅是你的代码样本。我们应该复制并粘贴你的代码,它就会运行。

这个想法

1.由于您使用的是ggplot2,它是grid绘图之王,我认为保存绘图/表格的一个简单的选择是使用gridExtra包。使用grid.arrangearrangeGrobs,您可以将您的grobs保存到预定义的设备。然后,downloadhandler将执行下载。
1.为了避免每次都重新生成所有的图,我认为一个解决方案是将它们保存在一个全局变量中,每次更改图时都要更新该变量。这里reactiveValues可以用来保存图和表以及动态变量。
溶液

用户界面

library(shiny)

shinyUI(fluidPage(

  # Application title
  titlePanel("Save ggplot plot/table without regenration"),

  # Sidebar with a slider input for number of bins
  sidebarLayout(
    sidebarPanel(
      downloadButton('export')
    ),

    # Show a plot of the generated distribution
    mainPanel(
      plotOutput("p1"),
      plotOutput("p2"),
      tableOutput("t1")
    )
  )
))

服务器.R

library(shiny)
library(ggplot2)
library(gridExtra)

shinyServer(function(input, output) {
  ## vals will contain all plot and table grobs
  vals <- reactiveValues(p1=NULL,p2=NULL,t1=NULL)

  ## Note that we store the plot grob before returning it 
  output$p1 <- renderPlot({
    vals$p1 <- qplot(speed, dist, data = cars)
    vals$p1
  })

  output$p2 <- renderPlot({
    vals$p2 <- qplot(mpg, wt, data = mtcars, colour = cyl)
    vals$p2
  })
  ## same thing for th etable grob
  output$t1 <- renderTable({
    dx <- head(mtcars)
    vals$t1 <- tableGrob(dx)
    dx
  })
  ## clicking on the export button will generate a pdf file 
  ## containing all grobs
  output$export = downloadHandler(
    filename = function() {"plots.pdf"},
    content = function(file) {
     pdf(file, onefile = TRUE)
     grid.arrange(vals$p1,vals$p2,vals$t1) 
     dev.off()
    }
  )
})

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