使用prcomp后如何绘制第二和第三主分量

brgchamk 于 2023-03-05 发布在其他

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使用prcomp后如何绘制第二、三主成分？
我最感兴趣的变量的第二和第三个主成分解释了更多的方差。
下面是我用于第一个和第二个的代码：

res.pca <- prcomp(data3, scale = TRUE)
fviz_eig(res.pca)

fviz_pca_ind(res.pca,
             col.ind = "cos2", # Color by the quality of representation
             gradient.cols = c("#00AFBB", "#E7B800", "#FC4E07"),
             repel = TRUE     # Avoid text overlapping
)

来源：https://stackoverflow.com/questions/66482456/how-to-plot-the-2nd-and-3rd-principle-component-after-using-prcomp

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按热度按时间

pftdvrlh1#

可以使用axes参数选择要显示的尺寸：

library(FactoMineR)
library(factoextra)

pca <- PCA(iris[,1:4])

fviz_pca_ind(pca,
             col.ind = "cos2", # Color by the quality of representation
             gradient.cols = c("#00AFBB", "#E7B800", "#FC4E07"),
             repel = TRUE,     # Avoid text overlapping
             axes = c(2, 3)
)

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